RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 SLX4Q8IY92 1834 aa3.65□□□□□ -1.82
PCAT4-201ENST00000504263 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa3.65□□□□□ -1.82
PCAT4-201ENST00000504263 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CLRN2A0PK11 232 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 OR5K3A6NET4 321 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRIM64A6NGJ6 449 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GLTPD2A6NH11 291 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRIM75PA6NK02 468 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LRRC53A6NM62 1247 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CFAP99D6REC4 459 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NUAK1O60285 661 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SNAP91O60641 907 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NTRK1P04629 796 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 S100A6P06703 90 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CALM1P0DP23 149 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CALM2P0DP24 149 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CALM3P0DP25 149 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 BMP2P12643 396 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CXCR2P25025 360 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 WEE1P30291 646 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MAN1A1P33908 653 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ETFBP38117 255 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GRIK1P39086 918 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 AFMP43652 599 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CBX5P45973 191 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SLC5A3P53794 718 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 AQP4P55087 323 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 STX1BP61266 288 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 JAG1P78504 1218 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MYBPC1Q00872 1141 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ECT2LQ008S8 904 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CAV1Q03135 178 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PRKCQQ04759 706 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 BTKQ06187 659 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FCHO2Q0JRZ9 810 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CDC20Q12834 499 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SELENBP1Q13228 472 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 STX3Q13277 289 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 STAT4Q14765 748 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PSMD6Q15008 389 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TLR1Q15399 786 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GRIK5Q16478 980 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PCSK7Q16549 785 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CYP1B1Q16678 543 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MAN2A1Q16706 1144 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRIM16LQ309B1 348 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 BBS9Q3SYG4 887 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZBED5Q49AG3 693 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ERFEQ4G0M1 354 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CEP78Q5JTW2 689 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SCARA3Q6AZY7 606 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TTC27Q6P3X3 843 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAM47EQ6ZV65 393 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 COPS6Q7L5N1 327 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GPR141Q7Z602 305 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF354CQ86Y25 554 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 JAMLQ86YT9 394 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RTKN2Q8IZC4 609 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LARGE2Q8N3Y3 721 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RNF169Q8NCN4 708 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ADCY4Q8NFM4 1077 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SLCO2A1Q92959 643 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TAMM41Q96BW9 452 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TXNDC15Q96J42 360 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAR2Q96K12 515 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TMEM87BQ96K49 555 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SPATA17Q96L03 361 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SNX18Q96RF0 628 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RMDN3Q96TC7 470 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GON7Q9BXV9 100 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FOXP3Q9BZS1 431 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CCSER1Q9C0I3 900 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 OR2B2Q9GZK3 357 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GLT8D2Q9H1C3 349 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RMND5AQ9H871 391 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RRAGCQ9HB90 399 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SYTL2Q9HCH5 934 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.65□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.65□□□□□ -1.83
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