RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 USP49Q70CQ1 688 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 UNC13DQ70J99 1090 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 C5orf34Q96MH7 638 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CIPCQ9C0C6 399 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 FAM204AQ9H8W3 233 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KLHL13Q9P2N7 655 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 VPS51Q9UID3 782 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 AMFRQ9UKV5 643 aa3.5□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 WDR17Q8IZU2 1322 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 GOLIM4O00461 696 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 RASSF9O75901 435 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 FGAP02671 866 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SLC5A1P13866 664 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ACVR2AP27037 513 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 EPHA3P29320 983 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 HTR7P34969 479 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 DIO1P49895 249 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CCT4P50991 539 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CACNB3P54284 484 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TIRAPP58753 221 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 LMAN2Q12907 356 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ARHGEF7Q14155 803 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KRT73Q86Y46 540 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CUL5Q93034 780 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 HMCESQ96FZ2 354 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KAZALD1Q96I82 304 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PPP1R9BQ96SB3 815 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 VPS16Q9H269 839 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 GJB4Q9NTQ9 266 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 DKK4Q9UBT3 224 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MAFFQ9ULX9 164 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 USP22Q9UPT9 525 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CORO2BQ9UQ03 480 aa3.49□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TMEM232C9JQI7 657 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 IKBKBO14920 756 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 DSCR3O14972 297 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CCP110O43303 1012 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KCNAB3O43448 404 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 GCATO75600 419 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 BCAR3O75815 825 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PIAS2O75928 621 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 RNF8O76064 485 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MT-ND5P03915 603 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 A1BGP04217 495 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 IL1R2P27930 398 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ARHGAP25P42331 645 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PIK3CBP42338 1070 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MTHFSP49914 203 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 FAM193AP78312 1265 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 STK3Q13188 491 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 FAM187BQ17R55 369 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PLAG1Q6DJT9 500 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CNGA4Q8IV77 575 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 RNF152Q8N8N0 203 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 C11orf44Q8N8P7 122 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CCDC17Q96LX7 622 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 LRRC27Q9C0I9 530 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 SNX15Q9NRS6 342 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 HDAC9Q9UKV0 1011 aa3.48□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 E5RJQ4 531 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 EXOC5O00471 708 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CES2O00748 559 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 KPNA5O15131 536 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 CPT1AP50416 773 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 PGDP52209 483 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms