RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CD302	Q8IX05	232 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TBX20	Q9UMR3	447 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CIT	O14578	2027 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP11A1	P05108	521 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	NFIC	P08651	508 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	BCKDHB	P21953	392 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	WSCD1	Q658N2	575 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	PLIN2	Q99541	437 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK13	Q9UKR3	277 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511		K7ENM7	598 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	PIR	O00625	290 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	NFATC1	O95644	943 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	ALB	P02768	609 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	CFI	P05156	583 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	PCSK2	P16519	638 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR15	P49685	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	NEK4	P51957	841 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	GPLD1	P80108	840 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	PLAUR	Q03405	335 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNB1	Q14721	858 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	DDR2	Q16832	855 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SV2C	Q496J9	727 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK18	Q7Z418	384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	FSIP1	Q8NA03	581 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511		H0Y626	953 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	LAD1	O00515	517 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM13A	O94988	1023 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM16	O95361	564 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G4B	P0C869	781 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	ENG	P17813	658 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX18	P35713	384 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	NCKAP1L	P55160	1127 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF77	Q15935	545 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	CRY1	Q16526	586 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	RASSF3	Q86WH2	238 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT12	Q8IV01	421 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	MYCT1	Q8N699	235 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	USP33	Q8TEY7	942 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	RLN3	Q8WXF3	142 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM206	Q9H813	350 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	DPP3	Q9NY33	737 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	KCND2	Q9NZV8	630 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	DERA	Q9Y315	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SKAP2-209	ENST00000497511	ANO9	A1A5B4	782 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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