RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491843.2

ZNF638-222, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 3

Gene ZNF638, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-222	ENST00000491843	CCDC17	Q96LX7	622 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	OBP2A	Q9NY56	170 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	MT-CO3	P00414	261 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	HRG	P04196	525 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	ATF3	P18847	181 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49	5e-6	■□□□□ 10.8
ZNF638-222	ENST00000491843	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	YAF2	Q8IY57	180 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	TIFA	Q96CG3	184 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	APOL5	Q9BWW9	433 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	RHCE	P18577	417 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	YY1	P25490	414 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	RHD	Q02161	417 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	TMEM65	Q6PI78	240 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	SNX15	Q9NRS6	342 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	DKK4	Q9UBT3	224 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF521	Q96K83	1311 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ZNF638-222	ENST00000491843	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	TMEM232	C9JQI7	657 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843		F8W8V4	182 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	IL1R2	P27930	398 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	MCM5	P33992	734 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	MMP13	P45452	471 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	SEMA5A	Q13591	1074 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843		Q4G0T1	1027 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	AQP7P3	A6NL99	342 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	BTBD19	C9JJ37	291 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843		M0R3H8	397 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	BCAR3	O75815	825 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	MT-ND5	P03915	603 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	DEUP1	Q05D60	604 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	RABEP1	Q15276	862 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	DENND2C	Q68D51	928 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	USP49	Q70CQ1	688 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	SNX22	Q96L94	193 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	VPS16	Q9H269	839 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	FCHO1	O14526	889 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	DSCR3	O14972	297 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	TMPRSS11D	O60235	418 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	PHKG2	P15735	406 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	PTGER1	P34995	402 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	HPSE	Q9Y251	543 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	ADAM10	O14672	748 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	PPEF2	O14830	753 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	SNX2	O60749	519 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	MOSPD3	O75425	235 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	INMT	O95050	263 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	A1BG	P04217	495 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	KCNB1	Q14721	858 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF638-222	ENST00000491843	SEC23B	Q15437	767 aa		5.68	□□□□□ -1.5

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