RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 MYBPC3Q14896 1274 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PLCL1Q15111 1095 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CALCRLQ16602 461 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 UBE2SQ16763 222 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 HYIQ5T013 277 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 NT5DC1Q5TFE4 455 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 BICRALQ6AI39 1079 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ISM2Q6H9L7 571 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 USP49Q70CQ1 688 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MYCT1Q8N699 235 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 C4orf32Q8N8J7 132 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 IQUBQ8NA54 791 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MLKLQ8NB16 471 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SPC24Q8NBT2 197 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 C3orf20Q8ND61 904 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 KIAA1191Q96A73 305 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CALML4Q96GE6 196 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 EPSTI1Q96J88 318 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 GSDMAQ96QA5 445 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 C7orf25Q9BPX7 421 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 LRFN3Q9BTN0 628 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 AMNQ9BXJ7 453 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 RAB34Q9BZG1 259 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM39BQ9GZU3 492 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CUEDC2Q9H467 287 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MANSC1Q9H8J5 431 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MAGEF1Q9HAY2 307 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ATP13A1Q9HD20 1204 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SERHLQ9NQF3 203 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 RMND1Q9NWS8 449 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MAN1B1Q9UKM7 699 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 WASF3Q9UPY6 502 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TMX2Q9Y320 296 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 EVPLQ92817 2033 aa3.12□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 A0A1W2PRG0 241 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TCRBV5S2A0A599 114 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FITM1A5D6W6 292 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 POM121BA6NF01 834 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 WASH4PA8MWX3 477 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CYP26A1O43174 497 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TIMM44O43615 452 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 OPHN1O60890 802 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PHF2O75151 1096 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MAFO75444 373 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 USP2O75604 605 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PCDH8O95206 1070 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 IL18RAPO95256 599 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TDP2O95551 362 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SERPINC1P01008 464 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CSTBP04080 98 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 RPN1P04843 607 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 THP07101 528 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FAHP16930 419 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TACR1P25103 407 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 APEX1P27695 318 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 HK3P52790 923 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 GSDMDP57764 484 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CDC42EP1Q00587 391 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PRKCQQ04759 706 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 NOGQ13253 232 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 IKZF1Q13422 519 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 STIM1Q13586 685 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PRKG1Q13976 671 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 DAG1Q14118 895 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 RAB39AQ14964 217 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 KARSQ15046 597 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TAF12Q16514 161 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 IL17AQ16552 155 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 C3orf36Q3SXR2 165 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 USH1GQ495M9 461 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FAM209BQ5JX69 171 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.11□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 KRT79Q5XKE5 535 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms