RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 NTSR1P30989 418 aa5.8□□□□□ -1.48
CCL20-204ENST00000489160 MCM7P33993 719 aa5.8□□□□□ -1.48
CCL20-204ENST00000489160 LIPAP38571 399 aa5.8□□□□□ -1.48
CCL20-204ENST00000489160 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CCL20-204ENST00000489160 BMPR2Q13873 1038 aa5.8□□□□□ -1.48
CCL20-204ENST00000489160 CLCA4Q14CN2 919 aa5.8□□□□□ -1.48
CCL20-204ENST00000489160 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
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CCL20-204ENST00000489160 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
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CCL20-204ENST00000489160 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
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CCL20-204ENST00000489160 ISCA1Q9BUE6 129 aa5.78□□□□□ -1.48
CCL20-204ENST00000489160 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CCL20-204ENST00000489160 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5.78□□□□□ -1.48
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CCL20-204ENST00000489160 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.77□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 TRIM63Q969Q1 353 aa5.77□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 SCLT1Q96NL6 688 aa5.77□□□□□ -1.49
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CCL20-204ENST00000489160 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.77□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.77□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.77□□□□□ -1.49
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