RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487270.5

RAD51B-210, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 2,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-210ENST00000487270 ARMCX1Q9P291 453 aa6.91□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 FETUBQ9UGM5 382 aa6.91□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.91□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.91□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.91□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 KAT6AQ92794 2004 aa6.91□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 RLFQ13129 1914 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 COPEO14579 308 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 UGT1A9O60656 530 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 SBF1O95248 1867 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 IL18RAPO95256 599 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 ZBED1O96006 694 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 VTNP04004 478 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 TPBGLP0DKB5 382 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 KITP10721 976 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 MYL2P10916 166 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 VDRP11473 427 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 CYP3A5P20815 502 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 PAX7P23759 505 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 PCK1P35558 622 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 ETV4P43268 484 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 BCAR1P56945 870 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 BMPR2Q13873 1038 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 TFDP2Q14188 446 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 KCNJ11Q14654 390 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 CA9Q16790 459 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 Q3C1V9 767 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 VPS52Q8N1B4 723 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 APOPT1Q96IL0 206 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 KCNK13Q9HB14 408 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 USP29Q9HBJ7 922 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 RNF19AQ9NV58 838 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 AKT3Q9Y243 479 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.9□□□□□ -1.3
RAD51B-210ENST00000487270 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 SMAPO00193 183 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 CYB561D2O14569 222 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 IRF6O14896 467 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 GYG2O15488 501 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 CCDC22O60826 627 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 WFS1O76024 890 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 UPP2O95045 317 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 P4HA1P13674 534 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 GNAZP19086 355 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 IL4RP24394 825 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 GABRB2P47870 512 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 CPA2P48052 419 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 SERPINB4P48594 390 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 ERFP50548 548 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 NEK3P51956 506 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 SLC8A3P57103 927 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 IRX4P78413 519 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 ACAP1Q15027 740 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 CCDC14Q49A88 953 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 PMF1Q6P1K2 205 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 RFX8Q6ZV50 586 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 OTUD5Q96G74 571 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 NSL1Q96IY1 281 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 MIS12Q9H081 205 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 PAK5Q9P286 719 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 GINS2Q9Y248 185 aa6.9□□□□□ -1.31
RAD51B-210ENST00000487270 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.9□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms