RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484971.1

GTPBP1-210, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-210ENST00000484971 SAAL1Q96ER3 474 aa14.94□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PCED1BQ96HM7 432 aa14.94□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 GABRG3Q99928 467 aa14.94□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.94□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 STRA6Q9BX79 667 aa14.94□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 TRIM9Q9C026 710 aa14.94□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.94□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.94□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 RAD54BQ9Y620 910 aa14.94□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PTPRJQ12913 1337 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 FAM149AA5PLN7 773 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PRRT4C9JH25 899 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 COCHO43405 550 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 CILPO75339 1184 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ZNF883P0CG24 379 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PLA2G2AP14555 144 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PPP3CCP48454 512 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 OTUB2Q96DC9 234 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 GAREM1Q9H706 876 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 CDH9Q9ULB4 789 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 A0A1B0GTW7 788 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 NDUFS2O75306 463 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 KRT19P08727 400 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PDGFRBP09619 1106 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 GNSP15586 552 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ANXA13P27216 316 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ITPKBP27987 946 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 CYP27A1Q02318 531 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 CHPFQ8IZ52 775 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 FOXJ1Q92949 421 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 C8orf48Q96LL4 319 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.92□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 KCNJ18B7U540 433 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 WASH3PC4AMC7 463 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 TK2O00142 265 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 TRIM66O15016 1216 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 CD6P30203 668 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ABCD1P33897 745 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 RBP5P82980 135 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 POSTNQ15063 836 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ANO4Q32M45 955 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 DPH6Q7L8W6 267 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 SFR1Q86XK3 245 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 RAD54LQ92698 747 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.91□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 GREM1O60565 184 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 MATKP42679 507 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ABCG1P45844 678 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 GRIN1Q05586 938 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PTPRNQ16849 979 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 HLA-BQ31612 363 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 P2RY11Q96G91 374 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 GPR174Q9BXC1 333 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GTPBP1-210ENST00000484971 PRORYQ9H606 182 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms