RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 WDR90Q96KV7 1748 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ZMYM6O95789 1325 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TSPY2A6NKD2 308 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 NUDT3O95989 172 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TSPY3P0CV98 308 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TSPY8P0CW00 308 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RPS6KB1P23443 525 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 YY1P25490 414 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TAP1Q03518 808 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 GABPAQ06546 454 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PPP3CAQ08209 521 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RESTQ13127 1097 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 KRT32Q14532 448 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SPDYE7PQ495Y7 208 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RUFY3Q7L099 469 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CDCA5Q96FF9 252 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM2Q99965 735 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 KRT23Q9C075 422 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TOR3AQ9H497 397 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 IL17RBQ9NRM6 502 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PDRG1Q9NUG6 133 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MCM8Q9UJA3 840 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 LAMB1P07942 1786 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TEX33O43247 280 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ORC4O43929 436 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CDKL5O76039 1030 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 POMCP01189 267 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 GH2P01242 217 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ITGAMP11215 1152 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RXRAP19793 462 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FPR1P21462 350 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PSMA5P28066 241 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 GUCY1A2P33402 732 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MCM5P33992 734 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MTNR1BP49286 362 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 AK2P54819 239 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MGAT2Q10469 447 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 STK3Q13188 491 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SEPT2Q15019 361 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RABEP1Q15276 862 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CLUL1Q15846 466 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 METRNLQ641Q3 311 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TATDN1Q6P1N9 297 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF529Q6P280 563 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 NECAB1Q8N987 351 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ESR2Q92731 530 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TTC14Q96N46 770 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ZSWIM1Q9BR11 485 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TM6SF1Q9BZW5 370 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 STX8Q9UNK0 236 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SSC5DA1L4H1 1573 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MYH8P13535 1937 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ROBO3Q96MS0 1386 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 COL4A3Q01955 1670 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MARCH11A6NNE9 402 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 GPR32O75388 356 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SPDEFO95238 335 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CELF2O95319 508 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 LARGE1O95461 756 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CFIP05156 583 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PDGFRBP09619 1106 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 HKR1P10072 659 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ERVK-21P61565 698 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RASGRP2Q7LDG7 609 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
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