RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482871.5

MSL3-215, Transcript of MSL complex subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene MSL3, Length 834 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3-215ENST00000482871 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.51□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 PIDD1Q9HB75 910 aa8.51□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.51□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.51□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 INTUQ9ULD6 942 aa8.51□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.51□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.51□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.51□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 COL1A2P08123 1366 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 TMEM150BA6NC51 233 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 MAGEB2O15479 319 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 ULK1O75385 1050 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 LYPLA2O95372 231 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 CD4P01730 458 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 PF4V1P10720 104 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 CYP2C9P11712 490 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 ITGB7P26010 798 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 KLRC1P26715 233 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 KIF11P52732 1056 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 BFSP2Q13515 415 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 SCN5AQ14524 2016 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 XKR9Q5GH70 373 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 TMEM240Q5SV17 173 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 IL31Q6EBC2 164 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 PDXDC1Q6P996 788 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 LRRC55Q6ZSA7 311 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 ANO5Q75V66 913 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 CPA6Q8N4T0 437 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 METTL13Q8N6R0 699 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 PIGOQ8TEQ8 1089 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 ISL2Q96A47 359 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 SCYL1Q96KG9 808 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 CEP170P1Q96L14 293 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 EMC7Q9NPA0 242 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 KCND2Q9NZV8 630 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 TET1Q8NFU7 2136 aa8.5□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 CCDC66A2RUB6 948 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 STBD1O95210 358 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 LCA5LO95447 670 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 MT-CO1P00395 513 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 SERPING1P05155 500 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 TCP1P17987 556 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 CYP11B2P19099 503 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 TMOD1P28289 359 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 HOXC8P31273 242 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 THPOP40225 353 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 NEK3P51956 506 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 NPEPPSP55786 919 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 ADAM17P78536 824 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 CYP4F3Q08477 520 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 GBX1Q14549 363 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 ASIC2Q16515 512 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 ZCWPW2Q504Y3 356 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 PLA2G4FQ68DD2 849 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 PAOXQ6QHF9 649 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 RRAGAQ7L523 313 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 RSPH3Q86UC2 560 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 SERINC5Q86VE9 423 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 FIBCD1Q8N539 461 aa8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
MSL3-215ENST00000482871 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms