RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 CDO1Q16878 200 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 RFWD2Q8NHY2 731 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CXorf38Q8TB03 319 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 STK32AQ8WU08 396 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TTC17Q96AE7 1141 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 FAM111AQ96PZ2 611 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 MMP19Q99542 508 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PDZD7Q9H5P4 517 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TLE6Q9H808 572 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 IFT122Q9HBG6 1241 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 C2CD2Q9Y426 696 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 EPHB2P29323 1055 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SCYL2Q6P3W7 929 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC62Q6P9F0 684 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 LRRC6Q86X45 466 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PLD5Q8N7P1 536 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 LRRC39Q96DD0 335 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SERAC1Q96JX3 654 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 DPP3Q9NY33 737 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 HEY2Q9UBP5 337 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 I3L4J1 428 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 IRF6O14896 467 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 KLF11O14901 512 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 DNAJC6O75061 913 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CNMDO75829 334 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SETSIPP0DME0 302 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SDC4P31431 198 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ETV4P43268 484 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 IGBP1P78318 339 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CDK16Q00536 496 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 AFG1LQ8WV93 481 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ACAP3Q96P50 834 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 USP29Q9HBJ7 922 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 AKT3Q9Y243 479 aa15.97■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 A0A087WZ62 844 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF487B1APH4 448 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TRIM49D1C9J1S8 452 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PEX11AO75192 247 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 FAM155BO75949 473 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TOMM70O94826 608 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 IQCF3P0C7M6 154 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 MAGEA6P43360 314 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SERPINB4P48594 390 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC14Q49A88 953 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SESTD1Q86VW0 696 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PPM1NQ8N819 430 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CFAP61Q8NHU2 1237 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 MTBPQ96DY7 904 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 NSL1Q96IY1 281 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 FGD4Q96M96 766 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF670Q9BS34 389 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 KRT38O76015 456 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TAF11Q15544 211 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 AMHR2Q16671 573 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ATG16L1Q676U5 607 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SLC9A4Q6AI14 798 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 GPC2Q8N158 579 aa15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 MCUQ8NE86 351 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms