RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	POU2F2	P09086	479 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ISCU	Q9H1K1	167 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	COMMD8	Q9NX08	183 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	OSER1	Q9NX31	292 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	EHD2	Q9NZN4	543 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MOSPD3	O75425	235 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	FBXO21	O94952	628 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	NDUFA10	O95299	355 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PAPLN	O95428	1278 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CALB1	P05937	261 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	RRM1	P23921	792 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	EPHA5	P54756	1037 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	GALC	P54803	685 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SNX16	P57768	344 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CCZ1B	P86790	482 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TFF2	Q03403	129 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TEAD2	Q15562	447 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	EDEM1	Q92611	657 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF653	Q96CK0	615 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TFR2	Q9UP52	801 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CLUH	O75153	1309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	C2orf78	A6NCI8	922 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CEBPB	P17676	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CDC25C	P30307	473 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC6A3	Q01959	620 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MON1A	Q86VX9	555 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	THAP2	Q9H0W7	228 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	POMK	Q9H5K3	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	LTF	P02788	710 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	FSHR	P23945	695 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MAGEA1	P43355	309 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SPA17	Q15506	151 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	POTEH	Q6S545	545 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	NCAN	O14594	1321 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF197	O14709	1029 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MDM4	O15151	490 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MBTPS2	O43462	519 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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