RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 TTC17Q96AE7 1141 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 SKA1Q96BD8 255 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 FAM210AQ96ND0 272 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 TSSK1BQ9BXA7 367 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 CXCL16Q9H2A7 254 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 C2CD4BA6NLJ0 364 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 AP1G2O75843 785 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 PTPN4P29074 926 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 SLC18A2Q05940 514 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 CA9Q16790 459 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 PLD5Q8N7P1 536 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 CYTH2Q99418 400 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 FAM167BQ9BTA0 163 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 BATF3Q9NR55 127 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 FZD9O00144 591 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 MT-ND3P03897 115 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 ROR1Q01973 937 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 VGLL4Q14135 290 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 RIOX2Q8IUF8 465 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 PQLC3Q8N755 202 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 CFAP36Q96G28 342 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 APOPT1Q96IL0 206 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 ADPGKQ9BRR6 497 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 SPATC1LQ9H0A9 340 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-214ENST00000473778 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 CYB561D2O14569 222 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 MED7O43513 233 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 LGR5O75473 907 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 GABBR2O75899 941 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 RNF8O76064 485 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 RBL1P28749 1068 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 FYB2Q5VWT5 728 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 RINLQ6ZS11 566 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 FBXO27Q8NI29 283 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF398Q8TD17 642 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 CPB2Q96IY4 423 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 RSAD1Q9HA92 442 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 POPDC2Q9HBU9 364 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 IRAK4Q9NWZ3 460 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 ARMCX1Q9P291 453 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 NME7Q9Y5B8 376 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 CEP350Q5VT06 3117 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 OTOFQ9HC10 1997 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 HMX2A2RU54 273 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 KCNN4O15554 427 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 ZBTB7AO95365 584 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 HMGCRP04035 888 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 STAG3L1P0CL83 205 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 TGFB3P10600 412 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 PDGFRAP16234 1089 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 PCK1P35558 622 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 SERPINB4P48594 390 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 RGS7P49802 495 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 BMPR2Q13873 1038 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 SURF1Q15526 300 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 TAF11Q15544 211 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 AMHR2Q16671 573 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf3-214ENST00000473778 CCDC14Q49A88 953 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms