RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ALX1	Q15699	326 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SPECC1	Q5M775	1068 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MROH9	Q5TGP6	573 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NXPE1	Q8N323	547 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CUL5	Q93034	780 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MTMR8	Q96EF0	704 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF558	Q96NG5	402 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ADAM2	Q99965	735 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MENT	Q9BUN1	341 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	AZI2	Q9H6S1	392 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SPG21	Q9NZD8	308 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NTM	Q9P121	344 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	DMD	P11532	3685 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KLRF2	D3W0D1	207 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KRIT1	O00522	736 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MAFK	O60675	156 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	RPS6KA5	O75582	802 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CXCL14	O95715	111 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KRT15	P19012	456 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MX1	P20591	662 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	FPR2	P25090	351 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NT5C2	P49902	561 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NEK2	P51955	445 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	EFEMP1	Q12805	493 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SLC9A5	Q14940	896 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	OSTM1	Q86WC4	334 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	LRRC43	Q8N309	656 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	DCLK2	Q8N568	766 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CNTD1	Q8N815	330 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NETO2	Q8NC67	525 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	RNF169	Q8NCN4	708 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	COG1	Q8WTW3	980 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CDHR1	Q96JP9	859 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	DCTPP1	Q9H773	170 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	EMC7	Q9NPA0	242 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CBLC	Q9ULV8	474 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CA14	Q9ULX7	337 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	USP18	Q9UMW8	372 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	FRYL	O94915	3013 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ZMYM6	O95789	1325 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NEDD4	P46934	1319 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	WDR81	Q562E7	1941 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SH3D21	A4FU49	640 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	GABRD	O14764	452 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF213	O14771	459 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TSPAN6	O43657	245 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NOBOX	O60393	691 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SP9	P0CG40	484 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	COL6A2	P12110	1019 aa		5.06	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms