RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 USP46P62068 366 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAM15Q13444 863 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 MTMR3Q13615 1198 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRE1Q14246 886 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 BEND5Q7L4P6 421 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 STKLD1Q8NE28 680 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 FEZF2Q8TBJ5 459 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF26Q96DR7 871 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 GCNAQ96QF7 691 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 PIDD1Q9HB75 910 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ASAH2Q9NR71 780 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 KCND1Q9NSA2 647 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCC13Q9NSE7 274 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM51Q9NW97 253 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 GMIPQ9P107 970 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM59LQ9UK28 342 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 RCCD1A6NED2 376 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 YJEFN3A6XGL0 299 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 E7ENQ6 273 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO1FO00160 1098 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF197O14709 1029 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 DAB1O75553 588 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 MTA2O94776 668 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC25CP30307 473 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP25P42331 645 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 HADHBP55084 474 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 BSPRYQ5W0U4 402 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 SCD5Q86SK9 330 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1524Q8TCG1 905 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 FNIP1Q8TF40 1166 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 CLEC4CQ8WTT0 213 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF139Q8WU17 664 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 MCEEQ96PE7 176 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 NCAPGQ9BPX3 1015 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 CORO1BQ9BR76 489 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 RRN3Q9NYV6 651 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 IP6K2Q9UHH9 426 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 STAP1Q9ULZ2 295 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-208ENST00000462602 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PQH9 124 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM191CA6NGB0 347 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 C2CD4BA6NLJ0 364 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SOBPA7XYQ1 873 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 GRAP2O75791 330 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 GLP2RO95838 553 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 ABL1P00519 1130 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 F11P03951 625 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 RHOP08100 348 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 NCAM1P13591 858 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 PDGFRAP16234 1089 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 PFKLP17858 780 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 GPD1P21695 349 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 GABRR2P28476 465 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SDC4P31431 198 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 NOS2P35228 1153 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 MATKP42679 507 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 TUBP50607 506 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-208ENST00000462602 EPHA5P54756 1037 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms