RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462392.5

IMP4-210, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene IMP4, Length 1,793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-210ENST00000462392 DCLK3Q9C098 648 aa21.45■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.028e-6■■■■■ 107
IMP4-210ENST00000462392 DGKIO75912 1065 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CD48P09326 243 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 USP17L7P0C7H9 530 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CSF2RAP15509 400 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 TBCBQ99426 244 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 NFU1Q9UMS0 254 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 KIAA0355O15063 1070 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 FGFR3P22607 806 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 TAZQ16635 292 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 BOLA3Q53S33 107 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 DCAF6Q58WW2 860 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 FUT8Q9BYC5 575 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 RAB17Q9H0T7 212 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 HOMER3Q9NSC5 361 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 E7ENQ6 273 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ZBED1O96006 694 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 RAG1P15918 1043 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CYP2F1P24903 491 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 NOS2P35228 1153 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CCNG2Q16589 344 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 SEC14L1Q92503 715 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ERP44Q9BS26 406 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 DAPK3O43293 454 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 SASH3O75995 380 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 SULT1E1P49888 294 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CDH6P55285 790 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CUL1Q13616 776 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ZNF280DQ6N043 979 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 STRADAQ7RTN6 431 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 TEKT4Q8WW24 435 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 TOP1MTQ969P6 601 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CALN1Q9BXU9 219 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 TRIM31Q9BZY9 425 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 DPH5Q9H2P9 285 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 VWA8A3KMH1 1905 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ENDOD1O94919 500 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ECEL1O95672 775 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 GRIK1P39086 918 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 EPHB4P54760 987 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 DUPD1Q68J44 220 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 NT5C3BQ969T7 300 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ATP8B1O43520 1251 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 FYNP06241 537 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ARSEP51690 589 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 RTP2Q5QGT7 225 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 MFSD5Q6N075 450 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 SLCO2A1Q92959 643 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 NPY6RQ99463 290 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CWH43Q9H720 699 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 PTPRDP23468 1912 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 OR6C75A6NL08 312 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CAPN9O14815 690 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 MDM4O15151 490 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 CST8O60676 142 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 LTFP02788 710 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 AMHP03971 560 aa21.4■■□□□ 1.02
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