RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455546.6

GTF3C3-208, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GTF3C3, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3-208ENST00000455546 GSTM4Q03013 218 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 TNK2Q07912 1038 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 RESTQ13127 1097 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 PLD1Q13393 1074 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CUL4AQ13619 759 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 MYBPC2Q14324 1141 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 PON2Q15165 354 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 TAF12Q16514 161 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 KYAT1Q16773 422 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CCDC142Q17RM4 750 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 TRIM68Q6AZZ1 485 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 SV2BQ7L1I2 683 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 METTL23Q86XA0 190 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 RELL1Q8IUW5 271 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 SULF2Q8IWU5 870 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CD302Q8IX05 232 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 SYCP3Q8IZU3 236 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 THEM5Q8N1Q8 247 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 SVOPQ8N4V2 548 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 PDILTQ8N807 584 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 LEMD2Q8NC56 503 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 ZBTB44Q8NCP5 570 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 RUBCNQ92622 972 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 DNASE1L2Q92874 299 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 KCNN1Q92952 543 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 HPS3Q969F9 1004 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 PSMG2Q969U7 264 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 DNAJC19Q96DA6 116 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 USP28Q96RU2 1077 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 FAM213AQ9BRX8 229 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 PI4K2AQ9BTU6 479 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 STRA6Q9BX79 667 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CEP44Q9C0F1 390 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 GPR88Q9GZN0 384 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 ASB7Q9H672 318 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 TRPV4Q9HBA0 871 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CBX8Q9HC52 389 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 PDE11AQ9HCR9 933 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 GKN1Q9NS71 199 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 PANK4Q9NVE7 773 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 ZSCAN32Q9NX65 697 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 NCDNQ9UBB6 729 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CCDC39Q9UFE4 941 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 FBXO4Q9UKT5 387 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 MAFFQ9ULX9 164 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 AGAP1Q9UPQ3 857 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 STYXL1Q9Y6J8 313 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 PI4KAP42356 2102 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CEP250Q9BV73 2442 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 THADAQ6YHU6 1953 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CHADO15335 359 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 ATP2C2O75185 946 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 PRAMEF12O95522 483 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 ECEL1O95672 775 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 BMP15O95972 392 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 B3GALT4O96024 378 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 ITGB3P05106 788 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CYP11A1P05108 521 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 KRT19P08727 400 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 TDGF1P13385 188 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 TGM1P22735 817 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CYP2F1P24903 491 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 LMO2P25791 158 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 CXCL12P48061 93 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 FNTBP49356 437 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 TUFMP49411 452 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 FCHO2Q0JRZ9 810 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 BFSP1Q12934 665 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 SEPT6Q14141 434 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 SLC39A14Q15043 492 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 POSTNQ15063 836 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 DDR2Q16832 855 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF3C3-208ENST00000455546 TXNDC8Q6A555 127 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms