RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 MROH9Q5TGP6 573 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PI16Q6UXB8 463 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MAGEC3Q8TD91 643 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TMEM260Q9NX78 707 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 FBXO21O94952 628 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PRR29P0C7W0 189 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZNF543Q08ER8 600 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 EMC2Q15006 297 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 KRT6AP02538 564 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 HMBSP08397 361 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ITGALP20701 1170 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ERO1BQ86YB8 467 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TMEM94Q12767 1356 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 DYTNA2CJ06 578 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MPOP05164 745 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 NFICP08651 508 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 COMTP21964 271 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PTPN3P26045 913 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 RPA1P27694 616 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 RENBPP51606 427 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CCDC153Q494R4 210 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CASP12Q6UXS9 341 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 USP33Q8TEY7 942 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ANKS1AQ92625 1134 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 REEP2Q9BRK0 252 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ALG6Q9Y672 507 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PMPCBO75439 489 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 LARGE1O95461 756 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 IRF1P10914 325 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 RCVRNP35243 200 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 BCAT1P54687 386 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 SBK1Q52WX2 424 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 USP38Q8NB14 1042 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 COQ7Q99807 217 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 SLC29A2Q14542 456 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MTSS1LQ765P7 747 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ITIH5Q86UX2 942 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 VMP1Q96GC9 406 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CHP1Q99653 195 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ACADMP11310 421 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CYP2A7P20853 494 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CASP1P29466 404 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ATP12AP54707 1039 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CYP24A1Q07973 514 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MAPK7Q13164 816 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 C2CD6Q53TS8 623 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ADSSL1Q8N142 457 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 DDIT4Q9NX09 232 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.88□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ASNA1O43681 348 aa6.87□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 KPNA6O60684 536 aa6.87□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PLA2G6O60733 806 aa6.87□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 LHX1P48742 406 aa6.87□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 NR2C2P49116 596 aa6.87□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PLD1Q13393 1074 aa6.87□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 NFYCQ13952 458 aa6.87□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ARID5BQ14865 1188 aa6.87□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 GALNTL6Q49A17 601 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms