RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 DTNBO60941 627 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 NDUFB8O95169 186 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 CREB1P16220 341 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 HSD3B2P26439 372 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 ARRB2P32121 409 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC11A2P49281 568 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 CFHR3Q02985 330 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC14A1Q13336 389 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF329Q86UD4 541 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 PRR18Q8N4B5 295 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 SCNM1Q9BWG6 230 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 DECR2Q9NUI1 292 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 GRID2O43424 1007 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 CAMTA2O94983 1202 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 EPN2O95208 641 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 THP07101 528 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 CCNIQ14094 377 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 CCDC157Q569K6 752 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 RFX8Q6ZV50 586 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC35A4Q96G79 324 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 MED30Q96HR3 178 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 TRHDEQ9UKU6 1024 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 USP22Q9UPT9 525 aa4.75□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 GABRDO14764 452 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 INPPL1O15357 1258 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 SPRY2O43597 315 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 TMPRSS11DO60235 418 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 NEUROG1Q92886 237 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 COG5Q9UP83 839 aa4.74□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A087WYN8 130 aa4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 PRKAR1BP31321 381 aa4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 BCAT1P54687 386 aa4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 PPATQ06203 517 aa4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 KEAP1Q14145 624 aa4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 USP45Q70EL2 814 aa4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 MIB2Q96AX9 1013 aa4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 LINC01565O15544 149 aa4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 HOXB2P14652 356 aa4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 P2RX3P56373 397 aa4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 PLA1AQ53H76 456 aa4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 SPARTQ8N0X7 666 aa4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 TMEM199Q8N511 208 aa4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC15A4Q8N697 577 aa4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 HIC2Q96JB3 615 aa4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 MED16Q9Y2X0 877 aa4.72□□□□□ -1.65
USP9YP28-201ENST00000435142 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 TLDC2A0PJX2 215 aa4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 SPTLC2O15270 562 aa4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 POLD2P49005 469 aa4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 LTBQ06643 244 aa4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM57BQ71RH2 274 aa4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.71□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 PLAUP00749 431 aa4.7□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 EPHA3P29320 983 aa4.7□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 ITKQ08881 620 aa4.7□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 PTGR1Q14914 329 aa4.7□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.7□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 KAZALD1Q96I82 304 aa4.7□□□□□ -1.66
USP9YP28-201ENST00000435142 TM2D2Q9BX73 214 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms