RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-211ENST00000429595 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-211ENST00000429595 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-211ENST00000429595 CA14Q9ULX7 337 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-211ENST00000429595 DUSP12Q9UNI6 340 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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PTPRK-211ENST00000429595 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.14□□□□□ -1.27
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PTPRK-211ENST00000429595 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRK-211ENST00000429595 CCPG1Q9ULG6 757 aa7.14□□□□□ -1.27
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PTPRK-211ENST00000429595 CAND2O75155 1236 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRK-211ENST00000429595 RETP07949 1114 aa7.11□□□□□ -1.27
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PTPRK-211ENST00000429595 CSRP2Q16527 193 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-211ENST00000429595 LPAL2Q16609 132 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-211ENST00000429595 LY6KQ17RY6 165 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-211ENST00000429595 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-211ENST00000429595 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-211ENST00000429595 C12orf60Q5U649 245 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-211ENST00000429595 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.11□□□□□ -1.27
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