RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 STILQ15468 1287 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 RAB21Q9UL25 225 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 SOX13Q9UN79 622 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRU-204ENST00000428026 NWD1Q149M9 1564 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 HSMCR30P0CW71 290 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RALBP11234 206 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SLC16A1P53985 500 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CHRNB3Q05901 458 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF677Q86XU0 584 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DPYSL4O14531 572 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ASMTLO95671 621 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 NUMBP49757 651 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RAD51Q06609 339 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FUKQ8N0W3 1084 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 OMA1Q96E52 524 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TOMM70O94826 608 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RGS2P41220 211 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ERVK-9P63128 1117 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PRKCEQ02156 737 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 NFYCQ13952 458 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SLC9A5Q14940 896 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 KCND2Q9NZV8 630 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CYP11B2P19099 503 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TM4SF1P30408 202 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TWF1Q12792 350 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF839A8K0R7 811 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 P4HA2O15460 535 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 EXTL3O43909 919 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SERPINB8P50452 374 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PTK6Q13882 451 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 NEDD8Q15843 81 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FAM83AQ86UY5 434 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FCHO1O14526 889 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RAG1P15918 1043 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SOX6P35712 828 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MMP14P50281 582 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CATSPER2Q96P56 530 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 APOL2Q9BQE5 337 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CUL2Q13617 745 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 KAT2BQ92831 832 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 BTBD7Q9P203 1132 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ICAM1P05362 532 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RRM1P23921 792 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 POU1F1P28069 291 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 WASHC5Q12768 1159 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TRAF2Q12933 501 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CYP11B1P15538 503 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PSMB9P28065 219 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TBCELQ5QJ74 424 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms