RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PHTF2Q8N3S3 785 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP11CQ8NB49 1132 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LTBP3Q9NS15 1303 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FXYD1O00168 92 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PEX1O43933 1283 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HIF1AQ16665 826 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3D19Q5HYK7 790 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LONP2Q86WA8 852 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EGFL6Q8IUX8 553 aa3.78□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 MAIP1Q8WWC4 291 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf112Q9NSG2 853 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PKD2L1Q9P0L9 805 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 B4GALT5O43286 388 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK7P50613 346 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HDAC4P56524 1084 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CETN1Q12798 172 aa3.78□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 XKR9Q5GH70 373 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD11Q693B1 232 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GPAT2Q6NUI2 795 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ARCQ7LC44 396 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MECRQ9BV79 373 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KLC2Q9H0B6 622 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DOCK1Q14185 1865 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJA2O60884 412 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHA2P01877 340 aa3.78□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 BGNP21810 368 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BRD2P25440 801 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GNA15P30679 374 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CDR1P51861 262 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMA5AQ13591 1074 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GSTA3Q16772 222 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KATNBL1Q9H079 304 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 WDR90Q96KV7 1748 aa3.78□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 IRF6O14896 467 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS6KA3P51812 740 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 AP1B1Q10567 949 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DLG1Q12959 904 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF169Q8NCN4 708 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM143Q96AN5 459 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SGIP1Q9BQI5 828 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.77□□□□□ -1.81
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PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 KMT5AQ9NQR1 393 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RIMS3Q9UJD0 308 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRD1A4D1F6 860 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 H0Y3Z8 333 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 C22orf31O95567 290 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC5A2P31639 672 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LSAMPQ13449 338 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MTMR2Q13614 643 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CEACAM7Q14002 265 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PCLAFQ15004 111 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 FXNQ16595 210 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LIN52Q52LA3 116 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DPY19L2Q6NUT2 758 aa3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ACAD11Q709F0 780 aa3.77□□□□□ -1.81
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