RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416748.1

NUP35P2-201, Transcript of nucleoporin 35 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene NUP35P2, Length 943 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35P2-201ENST00000416748 GLP2RO95838 553 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 SCGB1D1O95968 90 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 ITGB1P05556 798 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 PRKCBP05771 671 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 GYS1P13807 737 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 OAS2P29728 719 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 GUCY1A2P33402 732 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 CCR9P51686 369 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 CTXN1P60606 82 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 CD69Q07108 199 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 CTBP1Q13363 440 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 MTM1Q13496 603 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 PTPAQ15257 358 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 C1QL3Q5VWW1 255 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 USP49Q70CQ1 688 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 KRT73Q86Y46 540 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 YAF2Q8IY57 180 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 OR7D4Q8NG98 312 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 OR6Y1Q8NGX8 325 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 CEP70Q8NHQ1 597 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 SCAMP5Q8TAC9 235 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 SSH3Q8TE77 659 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 RADILQ96JH8 1075 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 MNTQ99583 582 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 MRGBPQ9NV56 204 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 LPAR3Q9UBY5 353 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 FZD1Q9UP38 647 aa4.73□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A087WWL8 130 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 GRXCR1A8MXD5 290 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 H0Y3Z8 333 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 PTP4A3O75365 173 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 CSF1P09603 554 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 RXRAP19793 462 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 ACTN2P35609 894 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 ATG16L1Q676U5 607 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 KIAA0408Q6ZU52 694 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 TMTC3Q6ZXV5 915 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 CHD1LQ86WJ1 897 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 MPP5Q8N3R9 675 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 NGEFQ8N5V2 710 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 MB21D1Q8N884 522 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 CCDC191Q8NCU4 936 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 TXLNGYQ9BZA5 131 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 PCDHAC1Q9H158 963 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 LDAHQ9H6V9 325 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 TMEM140Q9NV12 185 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 MID2Q9UJV3 735 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 CA14Q9ULX7 337 aa4.72□□□□□ -1.65
NUP35P2-201ENST00000416748 TMEM233B4DJY2 109 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 PCDH17O14917 1159 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 MFAP3LO75121 409 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 USP1O94782 785 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 FSBPO95073 299 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 ANXA1P04083 346 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 GNAI3P08754 354 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 NR4A1P22736 598 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 PCSK1P29120 753 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 CCT4P50991 539 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 GNAI1P63096 354 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 SCAPQ12770 1279 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 CDC16Q13042 620 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 GPR162Q16538 588 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 HECTD3Q5T447 861 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 TMTC4Q5T4D3 741 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 SNX30Q5VWJ9 437 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.71□□□□□ -1.66
NUP35P2-201ENST00000416748 CLEC14AQ86T13 490 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms