RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 LIASO43766 372 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF623O75123 536 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 GNRH1P01148 92 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 LCP1P13796 627 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ATF2P15336 505 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DESP17661 470 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 KDELR1P24390 212 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TKTP29401 623 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SDC4P31431 198 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 VPS41P49754 854 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 APLP1P51693 650 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC8A3P57103 927 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DYNLT1P63172 113 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP11AP98196 1134 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 LMNB2Q03252 620 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CEP85LQ5SZL2 805 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 KCTD6Q8NC69 237 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM81AQ8TBF8 368 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ART4Q93070 314 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SNF8Q96H20 258 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ADAM2Q99965 735 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 NACA2Q9H009 215 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DNPEPQ9ULA0 475 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa10.45□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A0U1RQF3 1178 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 GOLGA6L10A6NI86 522 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PRPSAP2O60256 369 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP2C2O75185 946 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP6V1G1O75348 118 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 GABBR2O75899 941 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM200BP0CF97 657 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ADCY8P40145 1251 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SCNN1BP51168 640 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DSC3Q14574 896 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC142Q17RM4 750 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC14Q49A88 953 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 LRIG3Q6UXM1 1119 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DSTYKQ6XUX3 929 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC89Q8N998 374 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ARL8AQ96BM9 186 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PEBP4Q96S96 227 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CALN1Q9BXU9 219 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TXLNGYQ9BZA5 131 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF148Q9UQR1 794 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 EFR3BQ9Y2G0 817 aa10.44□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DPYSL4O14531 572 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 GABRDO14764 452 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CST8O60676 142 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 POMCP01189 267 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CD48P09326 243 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ITIH2P19823 946 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 RPL9P32969 192 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ACADSBP45954 432 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PMS2P54278 862 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB6CQ53S08 254 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TTMPQ5BVD1 217 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM26DQ5JW98 314 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SPDYCQ5MJ68 293 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SCYL2Q6P3W7 929 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 FUKQ8N0W3 1084 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM86AQ8N2M4 240 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 C3orf58Q8NDZ4 430 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 OR2W6PQ8NHA6 318 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM76AQ8TAV0 307 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CLEC4CQ8WTT0 213 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM172AQ8WUF8 416 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PGBD4Q96DM1 585 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 HSFY1Q96LI6 401 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 MED10Q9BTT4 135 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB6CQ9H0N0 254 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CYLDQ9NQC7 956 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PQY0 241 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CKBP12277 381 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SKIP12755 728 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 NPR3P17342 541 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CA8P35219 290 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 LHX1P48742 406 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TRPC1P48995 793 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 VCPP55072 806 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CDH6P55285 790 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms