RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 STX3Q13277 289 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 ARCQ7LC44 396 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF410Q86VK4 478 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 CD97P48960 835 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 KLHL35Q6PF15 583 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PQLC1Q8N2U9 271 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PADI4Q9UM07 663 aa22.69■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 CRTAMO95727 393 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 GNA15P30679 374 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 CBLBQ13191 982 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 HIPK4Q8NE63 616 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 MAGEB3O15480 346 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 FAM189A1O60320 539 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 ITGAXP20702 1163 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 ALDH1B1P30837 517 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 OGDHQ02218 1023 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 HPS6Q86YV9 775 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 FAIMQ9NVQ4 179 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 CEPT1Q9Y6K0 416 aa22.68■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 POLR2MP0CAP2 368 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 ATP6V1B1P15313 513 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 MMP8P22894 467 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 NR1H2P55055 460 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 GTF2IP78347 998 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 BBS12Q6ZW61 710 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF778Q96MU6 729 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 E9PBE3 544 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 SIN3BO75182 1162 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 DYNLT1P63172 113 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PHEXP78562 749 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 LPIN1Q14693 890 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 CNGA3Q16281 694 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 WDR44Q5JSH3 913 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 LGSNQ5TDP6 509 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM126BQ8IUX1 230 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 DEFB107AQ8IZN7 70 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 BBS5Q8N3I7 341 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PPM1NQ8N819 430 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF516Q92618 1163 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 AP4B1Q9Y6B7 739 aa22.67■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 VARSP26640 1264 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 MTTPP55157 894 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 DPYSL3Q14195 570 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 FAM84AQ96KN4 292 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 MCEEQ96PE7 176 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 APOL6Q9BWW8 343 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 AK5Q9Y6K8 562 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.66■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.65■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.65■■□□□ 1.22
CLDN5-201ENST00000403084 HDAC4P56524 1084 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms