RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 CALB2P22676 271 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 DDI1Q8WTU0 396 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 C2orf81A6NN90 581 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 KLRK1P26718 216 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 WEE1P30291 646 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 EXD1Q8NHP7 514 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 TMC2Q8TDI7 906 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 NPTX2P47972 431 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 CACHD1Q5VU97 1274 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 CHMP1BQ7LBR1 199 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 AK9Q5TCS8 1911 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 CYTH3O43739 400 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 MCL1Q07820 350 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 C2CD6Q53TS8 623 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 DPP7Q9UHL4 492 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 SPACA6W5XKT8 324 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 SUPT7LO94864 414 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 RAG1P15918 1043 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 GUCA1CO95843 209 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF786Q8N393 782 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 PROSCO94903 275 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ACER1Q8TDN7 264 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 TM9SF1O15321 606 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 GSNP06396 782 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 KPNA6O60684 536 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 CCNG2Q16589 344 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF333Q96JL9 665 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 DSEQ9UL01 958 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 THP07101 528 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ARP10275 920 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 AMPD2Q01433 879 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKS6Q68DC2 871 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 USP32Q8NFA0 1604 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 PDHXO00330 501 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ENDOD1O94919 500 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF286BP0CG31 522 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 CYP24A1Q07973 514 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 NUMBP49757 651 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 IYDQ6PHW0 289 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 C10orf53Q8N6V4 93 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD28-201ENST00000399451 MLNP12872 115 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 AQP5P55064 265 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 PLCL1Q15111 1095 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 GPR141Q7Z602 305 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 ACOT1Q86TX2 421 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 CIPCQ9C0C6 399 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 USP18Q9UMW8 372 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 OXCT1P55809 520 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 SEL1L3Q68CR1 1132 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC26A11Q86WA9 606 aa22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms