RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 TXNRD2Q9NNW7 524 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 DPP3Q9NY33 737 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 PIK3R2O00459 728 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 APOL1O14791 398 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 KCNN4O15554 427 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 CBX6O95503 412 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 INSRRP14616 1297 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 ETV4P43268 484 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 SH2D5Q6ZV89 423 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 RFWD2Q8NHY2 731 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 C2CD2Q9Y426 696 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 PTPN4P29074 926 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC14Q49A88 953 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 DLK2Q6UY11 383 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 CLNKQ7Z7G1 428 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 SLC26A11Q86WA9 606 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 TUBB6Q9BUF5 446 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 KANSL3Q9P2N6 904 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 RBPJLQ9UBG7 517 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 DCTN4Q9UJW0 460 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 CXCL11O14625 94 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 TGDSO95455 350 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 PFKMP08237 780 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 CCNG1P51959 295 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 OVGP1Q12889 678 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 Q3C1V9 767 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 NT5DC4Q86YG4 428 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 PTPRN2Q92932 1015 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 AKT3Q9Y243 479 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 GRAP2O75791 330 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 PYGBP11216 843 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 IREB2P48200 963 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 BCAR1P56945 870 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01465Q8N7H1 131 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 FAM13CQ8NE31 585 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 CFAP36Q96G28 342 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 KLC2Q9H0B6 622 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 TLE6Q9H808 572 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 PDGFCQ9NRA1 345 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 ZBED1O96006 694 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 IL4RP24394 825 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 SLC8A3P57103 927 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 SCYL2Q6P3W7 929 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 ACAP3Q96P50 834 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 FAM111AQ96PZ2 611 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 PPP1R16BQ96T49 567 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 TBCBQ99426 244 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 PCDH18Q9HCL0 1135 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 TTLL3Q9Y4R7 772 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXD13-201ENST00000392539 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 AVILO75366 819 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 IL1BP01584 269 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 NEFHP12036 1026 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 DESP17661 470 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 CTC1Q2NKJ3 1217 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 SYCP2LQ5T4T6 812 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 SLC9A4Q6AI14 798 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC6Q86X45 466 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 ERO1BQ86YB8 467 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 PQLC3Q8N755 202 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF180Q9UJW8 692 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 FAM155BO75949 473 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 RBL1P28749 1068 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 MAGEA6P43360 314 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 ARFIP2P53365 341 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 WASHC2DQ5SRD0 308 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 C4orf22Q6V702 233 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 TTC17Q96AE7 1141 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 HEY1Q9Y5J3 304 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 TRIP11Q15643 1979 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 A0A0G2JND7 137 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 OSBPP22059 807 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 EPHB2P29323 1055 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 RGS7P49802 495 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 OLFML1Q6UWY5 402 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 FAM172AQ8WUF8 416 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 AFG1LQ8WV93 481 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD27Q96NW4 1050 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 MROH8Q9H579 483 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 ETNK2Q9NVF9 386 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXD13-201ENST00000392539 ASB14A6NK59 587 aa27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms