RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 CYLDQ9NQC7 956 aa21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP26A1O43174 497 aa21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC192P0DO97 292 aa21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 DRD1P21728 446 aa21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 MLKLQ8NB16 471 aa21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 OSER1Q9NX31 292 aa21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.71■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
UBE2E3-201ENST00000392415 E2F8A0AVK6 867 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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UBE2E3-201ENST00000392415 SATB1Q01826 763 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 SGO2Q562F6 1265 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC30AQ86WT1 665 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 CD101Q93033 1021 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 NMUR1Q9HB89 426 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1257Q9ULG3 409 aa21.7■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF292O60281 2723 aa21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 EGFP01133 1207 aa21.69■■□□□ 1.06
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UBE2E3-201ENST00000392415 PSEN1P49768 467 aa21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC8A3P57103 927 aa21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 GAB4Q2WGN9 574 aa21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 RAB41Q5JT25 222 aa21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PIGZQ86VD9 579 aa21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF276Q8N554 614 aa21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 NACA2Q9H009 215 aa21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1W2PQH9 124 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 TBX18O95935 607 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP17A1P05093 508 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 NRLP54845 237 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 GCNT1Q02742 428 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 DHCR24Q15392 516 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM270Q6UE05 265 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 SCD5Q86SK9 330 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 KAT5Q92993 513 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 OTUB2Q96DC9 234 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.68■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa21.68■■□□□ 1.06
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UBE2E3-201ENST00000392415 LILRB5O75023 590 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PAEPP09466 180 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 RARGP13631 454 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 CD19P15391 556 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 OPRD1P41143 372 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 BCAT1P54687 386 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO43Q4G163 708 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 WBP2Q969T9 261 aa21.67■■□□□ 1.06
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UBE2E3-201ENST00000392415 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 HESX1Q9UBX0 185 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 NAGPAQ9UK23 515 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 K7ESF4 209 aa21.66■■□□□ 1.06
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UBE2E3-201ENST00000392415 RNF40O75150 1001 aa21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PDE4CQ08493 712 aa21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 HTR3DQ70Z44 454 aa21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 RRAGAQ7L523 313 aa21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.66■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 TULP2O00295 520 aa21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 ATG13O75143 517 aa21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 ADH1CP00326 375 aa21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PKDCCQ504Y2 493 aa21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.65■■□□□ 1.06
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