RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 SNF8Q96H20 258 aa25.4■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 RUFY1Q96T51 708 aa25.4■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 PKMYT1Q99640 499 aa25.4■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 SH3GL2Q99962 352 aa25.4■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 ADAM33Q9BZ11 813 aa25.4■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF148Q9UQR1 794 aa25.4■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 NDUFV1P49821 464 aa25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 CACNA2D1P54289 1103 aa25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 DPYSL3Q14195 570 aa25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 STRADAQ7RTN6 431 aa25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 GSTA5Q7RTV2 222 aa25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 SLC35B2Q8TB61 432 aa25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 FAM149B1Q96BN6 582 aa25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 KCNK16Q96T55 309 aa25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 TMEM30AQ9NV96 361 aa25.39■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 ITGAVP06756 1048 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ATF2P15336 505 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 RAB41Q5JT25 222 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 VSIG1Q86XK7 387 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 DEFB106AQ8N104 65 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 OR10T2Q8NGX3 314 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 APBB2Q92870 758 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 OPA1O60313 960 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 KLRC2P26717 231 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 MMRN1Q13201 1228 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 KRT81Q14533 505 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 SLC25A52Q3SY17 297 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 SPDYCQ5MJ68 293 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ALLCQ8N6M5 410 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ACTL9Q8TC94 416 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 CNGB3Q9NQW8 809 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa25.38■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 HHLA1C9JL84 531 aa25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 TP73O15350 636 aa25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 KRT14P02533 472 aa25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ADCY8P40145 1251 aa25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 OR1G1P47890 313 aa25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ERMARDQ5T6L9 678 aa25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 CCHCR1Q8TD31 782 aa25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ULBP1Q9BZM6 244 aa25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 APOC2P02655 101 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 NOS2P35228 1153 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 TFDP2Q14188 446 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 NT5C3BQ969T7 300 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 SLC2A13Q96QE2 648 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 TMEM209Q96SK2 561 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 PCDH18Q9HCL0 1135 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 TMLHEQ9NVH6 421 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 DNAJB4Q9UDY4 337 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 PLAAQ9Y263 795 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 RNF40O75150 1001 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 RABGGTBP53611 331 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 DAOAP59103 153 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 TSPY1Q01534 308 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 CAV1Q03135 178 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 DCAF6Q58WW2 860 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 LRIG3Q6UXM1 1119 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 LRRTM3Q86VH5 581 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ABI1Q8IZP0 508 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 BBOF1Q8ND07 529 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 RNF157Q96PX1 679 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 POPDC2Q9HBU9 364 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.36■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF487B1APH4 448 aa25.35■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 NRP1O14786 923 aa25.35■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 IL4RP24394 825 aa25.35■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 SULT1E1P49888 294 aa25.35■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 CA9Q16790 459 aa25.35■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 RHBDF2Q6PJF5 856 aa25.35■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.35■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 BDNFP23560 247 aa25.34■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 VPS41P49754 854 aa25.34■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 TCTN1Q2MV58 587 aa25.34■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa25.34■■□□□ 1.65
SERF1B-201ENST00000380750 BNIPLQ7Z465 357 aa25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms