RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLSTN1O94985 981 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 KAT7O95251 611 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 NR2F2P24468 414 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 LMO2P25791 158 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC6A11P48066 632 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 CASP4P49662 377 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP46P62068 366 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNNC1P63316 161 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP27A1Q02318 531 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 BIRC3Q13489 604 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 NFIL3Q16649 462 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PGBD3Q8N328 593 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMARCE1Q969G3 411 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.37■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-204ENST00000373166 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 CPQQ9Y646 472 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 OBSL1O75147 1896 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 A0A0A0MRY4 1105 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM66O15016 1216 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADH1CP00326 375 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABL1P00519 1130 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOXD12P35452 270 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRIA2P42262 883 aa20.36■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SFTPA1Q8IWL2 248 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 FRMD1Q8N878 549 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 HMGB4Q8WW32 186 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 MMS19Q96T76 1030 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 CFIP05156 583 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDGFRBP09619 1106 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATICP31939 592 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SEMA3BQ13214 749 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 EMC10Q5UCC4 262 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PIP4P1Q86T03 277 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 CEP76Q8TAP6 659 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMC2Q8TDI7 906 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF516Q92618 1163 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PILRBQ9UKJ0 227 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 AKAP13Q12802 2813 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 H0Y626 953 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAPK13O15264 365 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM16O95361 564 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 OLFM2O95897 454 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADH5P11766 374 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLDN10P78369 228 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 MESP2Q0VG99 397 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACAP1Q15027 740 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCED1BQ96HM7 432 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 C8orf48Q96LL4 319 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 F8VP50 259 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC3-204ENST00000373166 AP5Z1O43299 807 aa20.33■□□□□ 0.85
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