RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 RNF38Q9H0F5 515 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO44Q9H4M3 255 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ECT2Q9H8V3 914 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CISHQ9NSE2 258 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 COMMD8Q9NX08 183 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 IL37Q9NZH6 218 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 GMIPQ9P107 970 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.09□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 CYP26A1O43174 497 aa8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 GNA14O95837 355 aa8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CYP17A1P05093 508 aa8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.09□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 BMP6P22004 513 aa8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CXCL12P48061 93 aa8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 NR1H3Q13133 447 aa8.09□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF394Q53GI3 561 aa8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TTI2Q6NXR4 508 aa8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.09□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 NELFBQ8WX92 580 aa8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TATDN2Q93075 761 aa8.09□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 EPC1Q9H2F5 836 aa8.09□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.09□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 TLR5O60602 858 aa8.08□□□□□ -1.12
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SGMS1-201ENST00000361543 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.08□□□□□ -1.12
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SGMS1-201ENST00000361543 KIF11P52732 1056 aa8.07□□□□□ -1.12
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SGMS1-201ENST00000361543 DMWDQ09019 674 aa8.07□□□□□ -1.12
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SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 GAB4Q2WGN9 574 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO43Q4G163 708 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 LONP2Q86WA8 852 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.07□□□□□ -1.12
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