RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359785.9

PTPN22-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN22, Length 3,654 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22-201ENST00000359785 GAAP10253 952 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 GRK2P25098 689 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ITGA8P53708 1063 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 NAA20P61599 178 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 CALCOCO2Q13137 446 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 MED21Q13503 144 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SEMA5AQ13591 1074 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SNX1Q13596 522 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SLC1A5Q15758 541 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ATG16L1Q676U5 607 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 MBLAC2Q68D91 279 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PI16Q6UXB8 463 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 THNSL1Q8IYQ7 743 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PELI3Q8N2H9 469 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 IL22Q9GZX6 179 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ACAD9Q9H845 621 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 CPNE5Q9HCH3 593 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 GCNT4Q9P109 453 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 RNF215Q9Y6U7 377 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 CFAP69A5D8W1 941 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 LRRIQ4A6NIV6 560 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 COMTP21964 271 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 HADHAP40939 763 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 BCAP31P51572 246 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ADCY7P51828 1080 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF543Q08ER8 600 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 LRRC41Q15345 812 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 BBS12Q6ZW61 710 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 TTC30AQ86WT1 665 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 KLHL7Q8IXQ5 586 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PPIL6Q8IXY8 311 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 GDAP1Q8TB36 358 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SIGLEC11Q96RL6 698 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 MYL10Q9BUA6 226 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 THAP2Q9H0W7 228 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 THAP1Q9NVV9 213 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 CD300AQ9UGN4 299 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 RAD54BQ9Y620 910 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 A0A1B0GVG6 124 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SFI1A8K8P3 1242 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ENTPD5O75356 428 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SLITRK3O94933 977 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ATF2P15336 505 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PSMA3P25788 255 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PCK1P35558 622 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ADARP55265 1226 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 TNK2Q07912 1038 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SPP2Q13103 211 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 CNGA3Q16281 694 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 ARL13BQ3SXY8 428 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SFT2D3Q587I9 215 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 NHSL2Q5HYW2 709 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SPOPLQ6IQ16 392 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 PGAM4Q8N0Y7 254 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 TBCKQ8TEA7 893 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 RASSF5Q8WWW0 418 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 STARD8Q92502 1023 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SLC45A3Q96JT2 553 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 KCNK16Q96T55 309 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SH2D3AQ9BRG2 576 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 BTBD2Q9BX70 525 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 DNAI2Q9GZS0 605 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 EBF3Q9H4W6 596 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 RMND5AQ9H871 391 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 MMRN2Q9H8L6 949 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 SIAEQ9HAT2 523 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPN22-201ENST00000359785 DIABLOQ9NR28 239 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms