RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 MAGEB18Q96M61 343 aa16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 DYRK1BQ9Y463 629 aa16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 CYP2C8P10632 490 aa16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 MAPK7Q13164 816 aa16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 DGKDQ16760 1214 aa16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 CASP10Q92851 521 aa16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 MAGED4Q96JG8 741 aa16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16.57■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 LAMC1P11047 1609 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 TIMM44O43615 452 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 SGPL1O95470 568 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 HDHD2Q9H0R4 259 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 PDHBP11177 359 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ADRM1Q16186 407 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 APOL2Q9BQE5 337 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 TUBE1Q9UJT0 475 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 KANSL1LA0AUZ9 987 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 CYP7B1O75881 506 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 KLHL18O94889 574 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 RPA1P27694 616 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 PSMC6P62333 389 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 COX10Q12887 443 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 KDM7AQ6ZMT4 941 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 NEK10Q6ZWH5 1172 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 CLPBQ9H078 707 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 VCPKMTQ9H867 229 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 KCNH7Q9NS40 1196 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ZNRF3Q9ULT6 936 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 TBX20Q9UMR3 447 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 DIP2BQ9P265 1576 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 DYRK3O43781 588 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 CAPN1P07384 714 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 CCT8P50990 548 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 CORO7P57737 925 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 VAC14Q08AM6 782 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 RIT2Q99578 217 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 SERHL2Q9H4I8 314 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 SERHLQ9NQF3 203 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ADAM30Q9UKF2 790 aa16.56■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 BAIAP3O94812 1187 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 YY1P25490 414 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 YWHAQP27348 245 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 IL5RAQ01344 420 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 KCNMA1Q12791 1236 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 GNASQ5JWF2 1037 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 STRA8Q7Z7C7 330 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 IFNA14P01570 189 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 HALP42357 657 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 C16orf72Q14CZ0 275 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 GPRASP2Q96D09 838 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ZNF862O60290 1169 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 CSNK2BP67870 215 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ITIH4Q14624 930 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 C11orf63Q6NUN7 778 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ATG9AQ7Z3C6 839 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ACOT1Q86TX2 421 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 TRPC4Q9UBN4 977 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 PSMB9P28065 219 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 GRK3P35626 688 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 OXCT1P55809 520 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 STRIP1Q5VSL9 837 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
RXRA-201ENST00000356384 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms