RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327681.10

USP45-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP45, Length 6,255 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45-201ENST00000327681 ALKBH4Q9NXW9 302 aa16.08■□□□□ 0.17
USP45-201ENST00000327681 SLC2A3P11169 496 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 ITGA8P53708 1063 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 VAC14Q08AM6 782 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 FGD3Q5JSP0 725 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 C12orf60Q5U649 245 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 E2F7Q96AV8 911 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 GRID1Q9ULK0 1009 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 TALDO1P37837 337 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 DSELQ8IZU8 1212 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 ERP27Q96DN0 273 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 TNFSF13BQ9Y275 285 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 TRPC5OSA6NMA1 111 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 MTA2O94776 668 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 LTFP02788 710 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 VAV1P15498 845 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 DPEP1P16444 411 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 TPGS1Q6ZTW0 290 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 TBC1D16Q8TBP0 767 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 OMDQ99983 421 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 UBXN6Q9BZV1 441 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 KLHL28Q9NXS3 571 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa16.08■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 EXTL3O43909 919 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 C4BPBP20851 252 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CLCN3P51790 818 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CAMK1Q14012 370 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 NEK7Q8TDX7 302 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 PRRG4Q9BZD6 226 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 RSAD1Q9HA92 442 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 ALDH2P05091 517 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 MAGEA4P43358 317 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 KCNJ1P48048 391 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 SLC9A7Q96T83 725 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 OPLAHO14841 1288 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 PACSIN1Q9BY11 444 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 PRKAB1Q9Y478 270 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 IL2P60568 153 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 FAM228AQ86W67 206 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 FIG4Q92562 907 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 ACTR8Q9H981 624 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CCDC189A1A4V9 331 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 PPP2R1BP30154 601 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CSHL1Q14406 222 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CRYMQ14894 314 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 STRIP1Q5VSL9 837 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 POTEAQ6S8J7 498 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.07■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 BAIAP3O94812 1187 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 ITGA3P26006 1051 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CCT8P50990 548 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 DET1Q7L5Y6 550 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 GPSM3Q9Y4H4 160 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 PNPLA4P41247 253 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 ITIH5Q86UX2 942 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 SPG21Q9NZD8 308 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CSF1RP07333 972 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 COMTP21964 271 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 ARMCX4Q5H9R4 360 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 SEMA4DQ92854 862 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 PDGFCQ9NRA1 345 aa16.06■□□□□ 0.16
USP45-201ENST00000327681 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms