RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 CDH8P55286 799 aa26.3■■□□□ 1.8
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SENP3-201ENST00000321337 C7orf26Q96N11 449 aa26.3■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 EBF3Q9H4W6 596 aa26.3■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 PPME1Q9Y570 386 aa26.3■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 SLC25A3Q00325 362 aa26.3■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 ROR1Q01973 937 aa26.3■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 XKR3Q5GH77 459 aa26.3■■□□□ 1.8
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SENP3-201ENST00000321337 ASPAP45381 313 aa26.29■■□□□ 1.8
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SENP3-201ENST00000321337 FAM189A1O60320 539 aa26.29■■□□□ 1.8
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SENP3-201ENST00000321337 BRSK2Q8IWQ3 736 aa26.29■■□□□ 1.8
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SENP3-201ENST00000321337 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.27■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 RALGPS1Q5JS13 557 aa26.27■■□□□ 1.8
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SENP3-201ENST00000321337 USP29Q9HBJ7 922 aa26.27■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 PDP2Q9P2J9 529 aa26.27■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 HMGXB4Q9UGU5 601 aa26.27■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 ETS2P15036 469 aa26.27■■□□□ 1.8
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SENP3-201ENST00000321337 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 WWP1Q9H0M0 922 aa26.27■■□□□ 1.8
SENP3-201ENST00000321337 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.8
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SENP3-201ENST00000321337 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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SENP3-201ENST00000321337 ITM2AO43736 263 aa26.26■■□□□ 1.79
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SENP3-201ENST00000321337 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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SENP3-201ENST00000321337 NDUFAF2Q8N183 169 aa26.26■■□□□ 1.79
SENP3-201ENST00000321337 LPAR1Q92633 364 aa26.26■■□□□ 1.79
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