RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.47■■□□□ 1.35
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HOXD4-201ENST00000306324 TRIM72Q6ZMU5 477 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM110Q86TL2 294 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 CMTM8Q8IZV2 173 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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HOXD4-201ENST00000306324 CLEC4CQ8WTT0 213 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 ASB16Q96NS5 453 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHB18PQ96TA0 734 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa23.46■■□□□ 1.35
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HOXD4-201ENST00000306324 HDCP19113 662 aa23.46■■□□□ 1.35
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HOXD4-201ENST00000306324 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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HOXD4-201ENST00000306324 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 SCD5Q86SK9 330 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 ERICH1Q86X53 443 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 DRC7Q8IY82 874 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.46■■□□□ 1.35
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HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.45■■□□□ 1.34
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HOXD4-201ENST00000306324 SOBPA7XYQ1 873 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 E7ENQ6 273 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 MFAP3LO75121 409 aa23.45■■□□□ 1.34
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HOXD4-201ENST00000306324 PARM1Q6UWI2 310 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 SCML4Q8N228 414 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 FGF14Q92915 247 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 NACA2Q9H009 215 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TLR5O60602 858 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
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HOXD4-201ENST00000306324 RARGP13631 454 aa23.44■■□□□ 1.34
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HOXD4-201ENST00000306324 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 HGSNATQ68CP4 663 aa23.44■■□□□ 1.34
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HOXD4-201ENST00000306324 GJD3Q8N144 294 aa23.44■■□□□ 1.34
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HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC7Q99615 494 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 SYT11Q9BT88 431 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 RNF38Q9H0F5 515 aa23.44■■□□□ 1.34
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HOXD4-201ENST00000306324 NUDT5Q9UKK9 219 aa23.44■■□□□ 1.34
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HOXD4-201ENST00000306324 RALAP11233 206 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 UNGP13051 313 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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HOXD4-201ENST00000306324 TUBP50607 506 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 C2CD6Q53TS8 623 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 OR6B2Q6IFH4 312 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TTC16Q8NEE8 873 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA1Q92805 767 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 KXD1Q9BQD3 176 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ZFP14Q9HCL3 533 aa23.43■■□□□ 1.34
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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HOXD4-201ENST00000306324 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 COCHO43405 550 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF12O95522 483 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TBX18O95935 607 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 PFKLP17858 780 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 HTR4Q13639 388 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TANGO2Q6ICL3 276 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 C18orf8Q96DM3 657 aa23.43■■□□□ 1.34
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