RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PQLC3Q8N755 202 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 C7orf31Q8N865 590 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 TEKT4Q8WW24 435 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 FAF2Q96CS3 445 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.05■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 A8MXQ7 604 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 KCNN4O15554 427 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 RECQL4O94761 1208 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 MAP3K6O95382 1288 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 MSH2P43246 934 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CCDC63Q8NA47 563 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 USP29Q9HBJ7 922 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GJD2Q9UKL4 321 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 DESP17661 470 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 TGM2P21980 687 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 AKAP5P24588 427 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 MNAT1P51948 309 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 BCAR1P56945 870 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PDK4Q16654 411 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GALNTL6Q49A17 601 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 HHATQ5VTY9 493 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ICE2Q659A1 982 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.04■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PCNTO95613 3336 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 TSHRP16473 764 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ADORA2BP29275 332 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 HDAC4P56524 1084 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 MGAT5Q09328 741 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 UNC93AQ86WB7 457 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 USP6NLQ92738 828 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 TBCBQ99426 244 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ECT2Q9H8V3 914 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CNTN3Q9P232 1028 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PAK5Q9P286 719 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CHADO15335 359 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ZBED1O96006 694 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PDGFRBP09619 1106 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CYP2C9P11712 490 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 CCDC130P13994 396 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 RBL1P28749 1068 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SNX16P57768 344 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 RNF43Q68DV7 783 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 FITM2Q8N6M3 262 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 MZB1Q8WU39 189 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 GLTPD2A6NH11 291 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 KBTBD13C9JR72 458 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 MDM4O15151 490 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 AVILO75366 819 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 NCALDP61601 193 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 FAXCQ5TGI0 409 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 STK32AQ8WU08 396 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 KLK14Q9P0G3 267 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 TEX264Q9Y6I9 313 aa20.02■□□□□ 0.8
USP21-201ENST00000289865 NRCAMQ92823 1304 aa20.01■□□□□ 0.79
USP21-201ENST00000289865 GOLGA8RI6L899 631 aa20.01■□□□□ 0.79
USP21-201ENST00000289865 ZWINTO95229 277 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms