RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 RNF157Q96PX1 679 aa16.47■□□□□ 0.23
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SLC20A1-201ENST00000272542 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SLC20A1-201ENST00000272542 GRIA1P42261 906 aa16.47■□□□□ 0.23
SLC20A1-201ENST00000272542 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa16.47■□□□□ 0.23
SLC20A1-201ENST00000272542 GNASQ5JWF2 1037 aa16.47■□□□□ 0.23
SLC20A1-201ENST00000272542 WSCD1Q658N2 575 aa16.47■□□□□ 0.23
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SLC20A1-201ENST00000272542 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa16.47■□□□□ 0.23
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SLC20A1-201ENST00000272542 SNX25Q9H3E2 840 aa16.46■□□□□ 0.23
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SLC20A1-201ENST00000272542 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
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SLC20A1-201ENST00000272542 KCNK16Q96T55 309 aa16.46■□□□□ 0.23
SLC20A1-201ENST00000272542 GAD1Q99259 594 aa16.46■□□□□ 0.23
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.46■□□□□ 0.23
SLC20A1-201ENST00000272542 TRABDQ9H4I3 376 aa16.46■□□□□ 0.23
SLC20A1-201ENST00000272542 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.22
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SLC20A1-201ENST00000272542 NME3Q13232 169 aa16.46■□□□□ 0.22
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SLC20A1-201ENST00000272542 CFAP36Q96G28 342 aa16.45■□□□□ 0.22
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SLC20A1-201ENST00000272542 AP5M1Q9H0R1 490 aa16.45■□□□□ 0.22
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SLC20A1-201ENST00000272542 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
SLC20A1-201ENST00000272542 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.44■□□□□ 0.22
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SLC20A1-201ENST00000272542 FAM228AQ86W67 206 aa16.44■□□□□ 0.22
SLC20A1-201ENST00000272542 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.44■□□□□ 0.22
SLC20A1-201ENST00000272542 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.44■□□□□ 0.22
SLC20A1-201ENST00000272542 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.44■□□□□ 0.22
SLC20A1-201ENST00000272542 CNTN3Q9P232 1028 aa16.44■□□□□ 0.22
SLC20A1-201ENST00000272542 AMHP03971 560 aa16.44■□□□□ 0.22
SLC20A1-201ENST00000272542 CYP2F1P24903 491 aa16.44■□□□□ 0.22
SLC20A1-201ENST00000272542 CRADDP78560 199 aa16.44■□□□□ 0.22
SLC20A1-201ENST00000272542 NOMO1Q15155 1222 aa16.44■□□□□ 0.22
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SLC20A1-201ENST00000272542 LGMNQ99538 433 aa16.44■□□□□ 0.22
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.44■□□□□ 0.22
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