RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GTF2H1P32780 548 aa20.1■□□□□ 0.81
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 TAF4BQ92750 862 aa20.1■□□□□ 0.81
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.06■□□□□ 0.8
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 SDCBP2Q9H190 292 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAP3K13O43283 966 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ALDH1A2O94788 518 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP27A1Q02318 531 aa20.05■□□□□ 0.8
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