RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr212Q7TS33 327 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zswim6Q80TB7 1207 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc181Q80ZU5 509 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pnma2Q8BHK0 365 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dus1lQ8C2P3 475 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cfap36Q8C6E0 343 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Uba3Q8C878 462 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pde10aQ8CA95 790 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q8CD60 292 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb6Q8K088 423 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Btbd6Q8K2J9 488 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spag16Q8K450 639 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxw7Q8VBV4 629 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr30Q8VGD8 315 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc65Q8VHI7 493 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PlvapQ91VC4 438 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdha3Q91Y16 942 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Susd3Q9D176 269 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ttc33Q9D6K7 262 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cwc15Q9JHS9 229 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem59Q9QY73 323 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EcsitQ9QZH6 435 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tubd1Q9R1K7 455 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Map2k5Q9WVS7 448 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bdp1Q571C7 2467 aa9.65□□□□□ -0.86
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adamts9E9PUN6 1931 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BC025446A0A087WQT1 134 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm9774A0A0A6YVU8 407 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r84D3YWE3 849 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 C7D3YXF5 845 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnk16G5E845 292 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NoctO35710 429 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt19P19001 403 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc1a2P43006 572 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Itga11P61622 1188 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 YwhazP63101 245 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Neurog2P70447 263 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ddr1Q03146 911 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cpne7Q0VE82 557 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem237Q3V0J1 427 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CttnQ60598 546 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SkiQ60698 725 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acvrl1Q61288 502 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rxfp1Q6R6I7 758 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Phf24Q80TL4 400 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem202Q80W35 275 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbed4Q80WQ9 1168 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Crb2Q80YA8 1282 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gcfc2Q8BKT3 769 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp120Q8BZW4 436 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lgi2Q8K4Z0 550 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Etv3Q8R4Z4 513 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Angel1Q8VCU0 667 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Evi2bQ8VD58 444 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Aipl1Q924K1 328 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PawrQ925B0 333 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tsnaxip1Q99P25 704 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Thg1lQ9CY52 298 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dusp6Q9DBB1 381 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Erap1Q9EQH2 930 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Strn3Q9ERG2 796 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GabrqQ9JLF1 638 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smok2bQ9QYZ3 484 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smok2aQ9QYZ6 504 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klrc2Q9WTJ9 238 aa9.64□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sf3b1Q99NB9 1304 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp8b4A2ANX3 1194 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ssxb9A2BI93 185 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp990B1AVN5 605 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DgkiD3YWQ0 1071 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arhgef26D3YYY8 869 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5795E9PZN8 263 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm6205E9PZS2 359 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpinb9O08797 374 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dmp1O55188 503 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cbfa2t2O70374 594 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CcnoP0C242 352 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfy2P20662 777 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc10a3P21129 473 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acvr2bP27040 536 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kif5cP28738 956 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ArvcfP98203 962 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PrlrQ08501 608 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Faf2Q3TDN2 445 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrgprx2Q3UG50 352 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lipo3Q3UT41 399 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Xkr5Q5GH66 676 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 UrgcpQ5NCI0 926 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q5XFZ0 217 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc20a1Q61609 681 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CochQ62507 552 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19 ms