RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kcnt2D3Z649 1135 aa13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kdelc2G5E897 503 aa13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Oaz2O08608 189 aa13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc11a2P49282 568 aa13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Klra3Q64329 266 aa13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcsk9Q80W65 694 aa13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Crb2Q80YA8 1282 aa13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nlrp4aQ8BU40 982 aa13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam163bQ8BUM6 167 aa13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Speer2E9Q9U2 264 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dmp1O55188 503 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PrkchP23298 683 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Krt80Q0VBK2 452 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ndrg1Q62433 394 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Myo6Q64331 1265 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gabbr2Q80T41 940 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hsd3b7Q9EQC1 369 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 St6galnac4Q9R2B6 360 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Bpifb9bA2AJD1 591 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm8113E0CXS8 587 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm21293E9Q4G9 266 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm5160F8VPN3 147 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Serpinb9O08797 374 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NrlP54846 237 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 TankP70347 448 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Stt3bQ3TDQ1 823 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vps41Q5KU39 853 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 RbfaQ6P3B9 350 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zdhhc17Q80TN5 632 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Baiap3Q80TT2 1134 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lrrc1Q80VQ1 524 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Bpifb9aQ80XI7 591 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ifi205aQ8CGE8 404 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Etv3Q8R4Z4 513 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcdhb19Q91Y01 801 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MlxiplQ99MZ3 864 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pin4Q9CWW6 131 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DmgdhQ9DBT9 869 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Strn3Q9ERG2 796 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trpc2Q9R244 1172 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kif26aQ52KG5 1881 aa13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Igkv18-36A0A075B5M9 114 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Osbpl9A2A8Z1 736 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 4930402K13RikB1AW18 415 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Scrg1O88745 98 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Odc1P00860 461 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tubb4bP68372 445 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rplp2P99027 115 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GscQ02591 256 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GstcdQ5RL51 634 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Thnsl1Q8BH55 747 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gcfc2Q8BKT3 769 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1502Q8VG66 316 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ipo4Q8VI75 1082 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ugp2Q91ZJ5 508 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gpr37l1Q99JG2 481 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kdelr1Q99JH8 212 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Clp1Q99LI9 425 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdh23Q99PF4 3354 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Snx24Q9CRB0 169 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trmt11Q9CWH5 460 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc8D3YZV8 685 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm3336J3QMQ6 198 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1022L7MTT3 315 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Grem1O70326 184 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hrh2P97292 397 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 HelqQ2VPA6 1069 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Six1Q62231 284 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Syn3Q8JZP2 579 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 OafQ8QZR4 282 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mettl13Q91YR5 698 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 FynP39688 537 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hsd17b2P51658 381 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dynlt1P51807 113 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ksr1Q61097 873 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sema3cQ62181 751 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rab34Q64008 259 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PtprjQ64455 1238 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fnip1Q68FD7 1165 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fut11Q8BHC9 489 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Smarcal1Q8BJL0 910 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r218Q8R261 298 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 SarafQ8R3Q0 334 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Erap1Q9EQH2 930 aa13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Noc2lQ9WV70 747 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 HpdP49429 393 aa13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam171bQ14CH0 825 aa13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pid1Q3UBG2 217 aa13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Upf3aQ3ULJ3 422 aa13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kctd12bQ8C7J6 292 aa13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prpf39Q8K2Z2 665 aa13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr345Q8VGK4 311 aa13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gemin2Q9CQQ4 269 aa13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 LactbQ9EP89 551 aa13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.4 ms