RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.45■■□□□ 1.5
CLN8-211ENST00000636934 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CLN8-211ENST00000636934 ZNF521Q96K83 1311 aa24.43■■□□□ 1.5
CLN8-211ENST00000636934 GOLGA2Q08379 1002 aa24.42■■□□□ 1.5
CLN8-211ENST00000636934 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CLN8-211ENST00000636934 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.41■■□□□ 1.5
CLN8-211ENST00000636934 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.41■■□□□ 1.5
CLN8-211ENST00000636934 PTPRMP28827 1452 aa24.4■■□□□ 1.5
CLN8-211ENST00000636934 ALKQ9UM73 1620 aa24.4■■□□□ 1.5
CLN8-211ENST00000636934 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.39■■□□□ 1.5
CLN8-211ENST00000636934 STK26Q9P289 416 aa24.37■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.37■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 POGKQ9P215 609 aa24.37■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 CFAP53Q96M91 514 aa24.36■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.34■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 CABP2Q9NPB3 220 aa24.34■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.34■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 DLC1Q96QB1 1528 aa24.33■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.33■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 SLFN5Q08AF3 891 aa24.33■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.33■■□□□ 1.49
CLN8-211ENST00000636934 APAF1O14727 1248 aa24.32■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 PRAM1Q96QH2 718 aa24.32■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.31■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.31■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 SHPRHQ149N8 1683 aa24.31■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 E9PSI1 815 aa24.3■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 ABCC11Q96J66 1382 aa24.3■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 MYT1Q01538 1121 aa24.29■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 MLECQ14165 292 aa24.29■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 A0A1W2PP64 1363 aa24.27■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CLN8-211ENST00000636934 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 RUNDC1Q96C34 613 aa24.26■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 MED14O60244 1454 aa24.26■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 ZMYM3Q14202 1370 aa24.25■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 MTHFSP49914 203 aa24.25■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.23■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 CDK19Q9BWU1 502 aa24.21■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 PLIN1O60240 522 aa24.21■■□□□ 1.47
CLN8-211ENST00000636934 CRBNQ96SW2 442 aa24.2■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.19■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 TNRQ92752 1358 aa24.19■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 WWC1Q8IX03 1113 aa24.18■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.18■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 CCDC27Q2M243 656 aa24.16■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 ATP7BP35670 1465 aa24.16■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.16■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 WDR63Q8IWG1 891 aa24.15■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 SIRT1Q96EB6 747 aa24.15■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.14■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.14■■□□□ 1.46
CLN8-211ENST00000636934 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.13■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 NLRP1Q9C000 1473 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 FYB1O15117 783 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.12■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 CABP1Q9NZU7 370 aa24.11■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 TECPR2O15040 1411 aa24.1■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 MS4A1P11836 297 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 ADGRB2O60241 1585 aa24.09■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.08■■□□□ 1.45
CLN8-211ENST00000636934 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.08■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 CPS1P31327 1500 aa24.06■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 METP08581 1390 aa24.06■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.06■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 NEUROD2Q15784 382 aa24.05■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.05■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 PDE3AQ14432 1141 aa24.03■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.03■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CLN8-211ENST00000636934 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.01■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CLN8-211ENST00000636934 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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