RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634315.1

DMD-232, Transcript of dystrophin, humanhuman

TSL 2

Gene DMD, Length 655 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMD-232ENST00000634315 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.33□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 PRDM2Q13029 1718 aa7.32□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 ZPR1O75312 459 aa7.32□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.32□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 PRR14Q9BWN1 585 aa7.32□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.31□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.31□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 GFRA3O60609 400 aa7.31□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.31□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 ERCC6Q03468 1493 aa7.3□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 CFHP08603 1231 aa7.3□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.3□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.3□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 CLCN1P35523 988 aa7.29□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 SLC4A3P48751 1232 aa7.29□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 RDH13Q8NBN7 331 aa7.29□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 GOPCQ9HD26 462 aa7.29□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.29□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.28□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
DMD-232ENST00000634315 A6NJR5 290 aa7.27□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 GGCXP38435 758 aa7.27□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 CD46P15529 392 aa7.26□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 SULF1Q8IWU6 871 aa7.26□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.25□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 TRAK2O60296 914 aa7.25□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 COPS2P61201 443 aa7.25□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.25□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.25□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 MS4A1P11836 297 aa7.24□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 GCGRP47871 477 aa7.24□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.24□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.24□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 CFTRP13569 1480 aa7.24□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 RNF223E7ERA6 249 aa7.23□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 FUT2Q10981 343 aa7.23□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.23□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 CUX2O14529 1486 aa7.23□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.23□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 WDR62O43379 1518 aa7.22□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 MCM6Q14566 821 aa7.22□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.22□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.22□□□□□ -1.25
DMD-232ENST00000634315 PRR20EP86478 221 aa7.21□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 PRR20CP86479 221 aa7.21□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 PRR20DP86480 221 aa7.21□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 PRR20BP86481 221 aa7.21□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 PRR20AP86496 221 aa7.21□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 HLA-CQ95604 372 aa7.21□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.21□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.2□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.2□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.2□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 KDM4AO75164 1064 aa7.19□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 SLC19A1P41440 591 aa7.19□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 SPRYD7Q5W111 196 aa7.19□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 TLL1O43897 1013 aa7.18□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 RAD21O60216 631 aa7.18□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 MORN1Q5T089 497 aa7.18□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.17□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 NR1I2O75469 434 aa7.17□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 ADH1BP00325 375 aa7.17□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 ATP6V1AP38606 617 aa7.17□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.17□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.17□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.17□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 HOXA2O43364 376 aa7.16□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 GUCA2AQ02747 115 aa7.16□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.16□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.16□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.16□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.16□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 GDF9O60383 454 aa7.15□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 DGAT1O75907 488 aa7.15□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.15□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
DMD-232ENST00000634315 S1PR4O95977 384 aa7.14□□□□□ -1.27
DMD-232ENST00000634315 NDUFV2P19404 249 aa7.14□□□□□ -1.27
DMD-232ENST00000634315 USP46P62068 366 aa7.14□□□□□ -1.27
DMD-232ENST00000634315 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DMD-232ENST00000634315 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.14□□□□□ -1.27
DMD-232ENST00000634315 TOPBP1Q92547 1522 aa7.14□□□□□ -1.27
DMD-232ENST00000634315 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.13□□□□□ -1.27
DMD-232ENST00000634315 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms