RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3-210ENST00000617904 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFT172Q9UG01 1749 aa23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3-210ENST00000617904 BRINP3Q76B58 766 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC3-210ENST00000617904 DCCP43146 1447 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRP6O75581 1613 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPLO60437 1756 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC7Q96M83 1385 aa23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC3-210ENST00000617904 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC3-210ENST00000617904 SHPRHQ149N8 1683 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3-210ENST00000617904 MST1RQ04912 1400 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANP32CO43423 234 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3-210ENST00000617904 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3-210ENST00000617904 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDCA8Q53HL2 280 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMF1P82094 1093 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 MIER1Q8N108 512 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIK3C2GO75747 1445 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTCH1Q13635 1447 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3-210ENST00000617904 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC3-210ENST00000617904 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3-210ENST00000617904 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC3-210ENST00000617904 AFF2P51816 1311 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3-210ENST00000617904 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCER2I3L3R5 266 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3-210ENST00000617904 ORAI2Q96SN7 254 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC3-210ENST00000617904 RXRBP28702 533 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 TESK2Q96S53 571 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRB1O14514 1584 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.273e-20■■■□□ 17.9
TRAPPC3-210ENST00000617904 C8orf37Q96NL8 207 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 TECPR2O15040 1411 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADAMTS2O95450 1211 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 POGKQ9P215 609 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 STK26Q9P289 416 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 EVC2Q86UK5 1308 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCC11Q96J66 1382 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 NGLY1Q96IV0 654 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGS12O14924 1447 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 PXDNQ92626 1479 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 DLC1Q96QB1 1528 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUTM2FA1L443 756 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 FOXO3O43524 673 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 RALBP1Q15311 655 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 SIRT1Q96EB6 747 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP21Q9UK80 565 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 PANK3Q9H999 370 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRAM1Q96QH2 718 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATRNO75882 1429 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3-210ENST00000617904 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.73■■□□□ 1.23
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