RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.44■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EVC2Q86UK5 1308 aa15.44■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WWC1Q8IX03 1113 aa15.43■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.42■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.42■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.42■□□□□ 0.06
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GLI2P10070 1586 aa15.41■□□□□ 0.06
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BACH2Q9BYV9 841 aa15.4■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIK3C2BO00750 1634 aa15.4■□□□□ 0.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.39■□□□□ 0.05
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.38■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.38■□□□□ 0.05
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.37■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.36■□□□□ 0.05
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBR1Q14596 966 aa15.36■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MS4A1P11836 297 aa15.36■□□□□ 0.05
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PP64 1363 aa15.35■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFAP53Q96M91 514 aa15.34■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PANK1Q8TE04 598 aa15.34■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHPRHQ149N8 1683 aa15.34■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.33■□□□□ 0.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPOAP1O95153 1857 aa15.33■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGS3P49796 1198 aa15.32■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NGEFQ8N5V2 710 aa15.32■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COG6Q9Y2V7 657 aa15.32■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFYVE9O95405 1425 aa15.32■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.31■□□□□ 0.04
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.31■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNNQ9UQP3 1299 aa15.31■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBLN1P23142 703 aa15.3■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK19Q9BWU1 502 aa15.3■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CABP1Q9NZU7 370 aa15.3■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHDP01880 384 aa15.3■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCC11Q96J66 1382 aa15.28■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TERF2IPQ9NYB0 399 aa15.28■□□□□ 0.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLUAP1Q96AJ1 413 aa15.27■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.27■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RLBP1P12271 317 aa15.27■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR63Q8IWG1 891 aa15.27■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NSD2O96028 1365 aa15.26■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP32Q8NFA0 1604 aa15.26■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDE3AQ14432 1141 aa15.26■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.25■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.25■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALKQ9UM73 1620 aa15.24■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.24■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.24■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.24■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC27Q2M243 656 aa15.23■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DIP2BQ9P265 1576 aa15.23■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C8orf34Q49A92 452 aa15.23■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHF1Q96S99 279 aa15.23■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.22■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC4A3P48751 1232 aa15.21■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM161AQ3B820 660 aa15.21■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.21■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.21■□□□□ 0.03
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.2■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.2■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.2■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.2■□□□□ 0.02
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.2■□□□□ 0.02
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