RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 TREML4Q6UXN2 200 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 AXIN1O15169 862 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 CD46P15529 392 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 MMP16P51512 607 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 Q3C1V9 767 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 WNT7AO00755 349 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 TRIM32Q13049 653 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 MAP2K5Q13163 448 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-212ENST00000580838 KDM4AO75164 1064 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 SMPD1P17405 629 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 HLA-CQ95604 372 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 IRF6O14896 467 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 J3QL48 77 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 USP46P62068 366 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 HOXA2O43364 376 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRM-212ENST00000580838 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 WFS1O76024 890 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 SKOR1P84550 965 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 GUCA2AQ02747 115 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 HPS1Q92902 700 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 CCDC102AQ96A19 550 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 HRCP23327 699 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 JUNDP17535 347 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 WNT7BP56706 349 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-212ENST00000580838 LCE2CQ5TA81 110 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 TRIM47Q96LD4 638 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 CLCN1P35523 988 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 SENP2Q9HC62 589 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 WIPF1O43516 503 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 RETREG3Q86VR2 466 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 ABCC9O60706 1549 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 SIAH2O43255 324 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 ALDH1A1P00352 501 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-212ENST00000580838 FDX1P10109 184 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 KIFC2Q96AC6 838 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 C6orf229H3BNL8 230 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 STK17AQ9UEE5 414 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 MS4A1P11836 297 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 SH3BP2P78314 561 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 NDUFV2P19404 249 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-212ENST00000580838 BMP1P13497 986 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 PTPRNQ16849 979 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 LINC01559Q495D7 138 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 PRR7Q8TB68 274 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 BAP1Q92560 729 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 KCNH2Q12809 1159 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 AMHR2Q16671 573 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 BARGINQ6ZT62 677 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-212ENST00000580838 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 MTMR2Q13614 643 aa9.14□□□□□ -0.95
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