RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRAM1Q96QH2 718 aa32.01■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POGKQ9P215 609 aa31.99■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNRQ92752 1358 aa31.99■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 INSRP06213 1382 aa31.97■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERICH6Q7L0X2 663 aa31.97■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADAMTS8Q9UP79 889 aa31.97■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP31.96■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC136Q96JN2 1154 aa31.96■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.91■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa31.9■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MORC1Q86VD1 984 aa31.88■■■□□ 2.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.87■■■□□ 2.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP32Q8NFA0 1604 aa31.86■■■□□ 2.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CGNL1Q0VF96 1302 aa31.86■■■□□ 2.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.84■■■□□ 2.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDE3BQ13370 1112 aa31.83■■■□□ 2.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATAD2Q6PL18 1390 aa31.83■■■□□ 2.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RRP1P56182 461 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.83■■■□□ 2.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DLC1Q96QB1 1528 aa31.82■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HDGFP51858 240 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NINLQ9Y2I6 1382 aa31.82■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.81■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PP64 1363 aa31.81■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 METP08581 1390 aa31.81■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDCA7LQ96GN5 454 aa31.8■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.8■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa31.8■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDK19Q9BWU1 502 aa31.8■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCC11Q96J66 1382 aa31.78■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RCAN3Q9UKA8 241 aa31.76■■■□□ 2.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BCL11AQ9H165 835 aa31.76■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC146Q8IYE0 955 aa31.75■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C3P01024 1663 aa31.74■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NLRP1Q9C000 1473 aa31.74■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.74■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NSD2O96028 1365 aa31.73■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TERF2IPQ9NYB0 399 aa31.72■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.71■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD163L1Q9NR16 1453 aa31.71■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EXOC6Q8TAG9 804 aa31.71■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CABP1Q9NZU7 370 aa31.68■■■□□ 2.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LTKP29376 864 aa31.67■■■□□ 2.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MTHFSP49914 203 aa31.67■■■□□ 2.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GGNBP2Q9H3C7 697 aa31.65■■■□□ 2.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SHPRHQ149N8 1683 aa31.65■■■□□ 2.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KNDC1Q76NI1 1749 aa31.64■■■□□ 2.66
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APAF1O14727 1248 aa31.63■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.63■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TECPR2O15040 1411 aa31.61■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.61■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF521Q96K83 1311 aa31.61■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WASLO00401 505 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CFAP53Q96M91 514 aa31.6■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CPS1P31327 1500 aa31.6■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM135BQ49AJ0 1406 aa31.6■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FYB1O15117 783 aa31.59■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EID1Q9Y6B2 187 aa31.58■■■□□ 2.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLGA2Q08379 1002 aa31.56■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SIRT1Q96EB6 747 aa31.56■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa31.55■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP7BP35670 1465 aa31.55■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.55■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ROBO2Q9HCK4 1378 aa31.54■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLIT1O75093 1534 aa31.52■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MED14O60244 1454 aa31.52■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa31.52■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DUSP27Q5VZP5 1158 aa31.52■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP31.52■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF20BQ96Q89 1820 aa31.51■■■□□ 2.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.51■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.48■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLFN5Q08AF3 891 aa31.47■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RUNDC1Q96C34 613 aa31.47■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLIN1O60240 522 aa31.45■■■□□ 2.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTPRUQ92729 1446 aa31.44■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NGEFQ8N5V2 710 aa31.44■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP31.44■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
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