RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557119.2

PITX2-209, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PITX2, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-209ENST00000557119 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX2-209ENST00000557119 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX2-209ENST00000557119 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 AGLP35573 1532 aa29.56■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.56■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.55■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.55■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.54■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 SHPRHQ149N8 1683 aa29.53■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 MS4A1P11836 297 aa29.53■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 MORC1Q86VD1 984 aa29.53■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 E9PSI1 815 aa29.52■■■□□ 2.32
PITX2-209ENST00000557119 APAF1O14727 1248 aa29.51■■■□□ 2.31
PITX2-209ENST00000557119 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.51■■■□□ 2.31
PITX2-209ENST00000557119 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
PITX2-209ENST00000557119 BCL11AQ9H165 835 aa29.5■■■□□ 2.31
PITX2-209ENST00000557119 CRBNQ96SW2 442 aa29.49■■■□□ 2.31
PITX2-209ENST00000557119 PLIN1O60240 522 aa29.48■■■□□ 2.31
PITX2-209ENST00000557119 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.46■■■□□ 2.31
PITX2-209ENST00000557119 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
PITX2-209ENST00000557119 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.45■■■□□ 2.3
PITX2-209ENST00000557119 PTPRMP28827 1452 aa29.44■■■□□ 2.3
PITX2-209ENST00000557119 RUNDC1Q96C34 613 aa29.41■■■□□ 2.3
PITX2-209ENST00000557119 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PITX2-209ENST00000557119 CFAP53Q96M91 514 aa29.4■■■□□ 2.3
PITX2-209ENST00000557119 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.4■■■□□ 2.3
PITX2-209ENST00000557119 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.4■■■□□ 2.3
PITX2-209ENST00000557119 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
PITX2-209ENST00000557119 MED14O60244 1454 aa29.39■■■□□ 2.3
PITX2-209ENST00000557119 ABCC11Q96J66 1382 aa29.39■■■□□ 2.3
PITX2-209ENST00000557119 CCDC27Q2M243 656 aa29.38■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.38■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 WWC1Q8IX03 1113 aa29.38■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 ALKQ9UM73 1620 aa29.37■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 MTHFSP49914 203 aa29.34■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 MLECQ14165 292 aa29.34■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 DLC1Q96QB1 1528 aa29.34■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 WDR63Q8IWG1 891 aa29.34■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.33■■■□□ 2.29
PITX2-209ENST00000557119 CABP2Q9NPB3 220 aa29.32■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 BACH2Q9BYV9 841 aa29.31■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 A0A1W2PP64 1363 aa29.31■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 PDE4AP27815 886 aa29.3■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 PDE3AQ14432 1141 aa29.29■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.29■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.28■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 ADGRB2O60241 1585 aa29.27■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.27■■■□□ 2.28
PITX2-209ENST00000557119 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.26■■■□□ 2.27
PITX2-209ENST00000557119 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.25■■■□□ 2.27
PITX2-209ENST00000557119 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
PITX2-209ENST00000557119 PRAM1Q96QH2 718 aa29.25■■■□□ 2.27
PITX2-209ENST00000557119 STK26Q9P289 416 aa29.24■■■□□ 2.27
PITX2-209ENST00000557119 NLRP1Q9C000 1473 aa29.24■■■□□ 2.27
PITX2-209ENST00000557119 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
PITX2-209ENST00000557119 POGKQ9P215 609 aa29.23■■■□□ 2.27
PITX2-209ENST00000557119 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
PITX2-209ENST00000557119 AAMPQ13685 434 aa29.22■■■□□ 2.27
PITX2-209ENST00000557119 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
PITX2-209ENST00000557119 BCAR3O75815 825 aa29.2■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.2■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.19■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 FYB1O15117 783 aa29.17■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.16■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 ATP7BP35670 1465 aa29.15■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 CDK19Q9BWU1 502 aa29.14■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.14■■■□□ 2.26
PITX2-209ENST00000557119 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.14■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.12■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 SIRT1Q96EB6 747 aa29.12■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.1■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.1■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.09■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.09■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.09■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
PITX2-209ENST00000557119 IL16Q14005 1332 aa29.07■■■□□ 2.24
PITX2-209ENST00000557119 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.07■■■□□ 2.24
PITX2-209ENST00000557119 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms