RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 POGZQ7Z3K3 1410 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 WWC1Q8IX03 1113 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 IGHDP01880 384 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 USP32Q8NFA0 1604 aa7.73□□□□□ -1.17
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PTPRB-211ENST00000552253 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 HECW2Q9P2P5 1572 aa7.72□□□□□ -1.17
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PTPRB-211ENST00000552253 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 PIK3C2BO00750 1634 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-211ENST00000552253 CD109Q6YHK3 1445 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 PDE3AQ14432 1141 aa7.7□□□□□ -1.18
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PTPRB-211ENST00000552253 MORC1Q86VD1 984 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
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PTPRB-211ENST00000552253 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 GGT6Q6P531 493 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 RUNDC1Q96C34 613 aa7.69□□□□□ -1.18
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PTPRB-211ENST00000552253 USP19O94966 1318 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.68□□□□□ -1.18
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PTPRB-211ENST00000552253 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
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PTPRB-211ENST00000552253 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 CCDC27Q2M243 656 aa7.68□□□□□ -1.18
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PTPRB-211ENST00000552253 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 USP35Q9P2H5 1018 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 TNNQ9UQP3 1299 aa7.68□□□□□ -1.18
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PTPRB-211ENST00000552253 SLC4A3P48751 1232 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 ZFYVE9O95405 1425 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
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PTPRB-211ENST00000552253 RGS3P49796 1198 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 COG6Q9Y2V7 657 aa7.67□□□□□ -1.18
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PTPRB-211ENST00000552253 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 IDI1Q13907 227 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 NEO1Q92859 1461 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 EVC2Q86UK5 1308 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 SEC24BO95487 1268 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 NEUROD2Q15784 382 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 CABP2Q9NPB3 220 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-211ENST00000552253 NSD2O96028 1365 aa7.65□□□□□ -1.19
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PTPRB-211ENST00000552253 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 MYO5BQ9ULV0 1848 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 OSCARQ8IYS5 282 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 RICTORQ6R327 1708 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 PTPRMP28827 1452 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 ABCC11Q96J66 1382 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 NFKBIBQ15653 356 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-211ENST00000552253 A0A1W2PP64 1363 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 AAMPQ13685 434 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
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PTPRB-211ENST00000552253 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 FYB1O15117 783 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 MED14O60244 1454 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
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