RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 GLI3P10071 1580 aa21.13■□□□□ 0.97
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CS-231ENST00000552222 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.11■□□□□ 0.97
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CS-231ENST00000552222 VPS72Q15906 364 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 USP32Q8NFA0 1604 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-231ENST00000552222 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.9■□□□□ 0.94
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CS-231ENST00000552222 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
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CS-231ENST00000552222 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
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CS-231ENST00000552222 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
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CS-231ENST00000552222 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-231ENST00000552222 KIF1BO60333 1816 aa20.86■□□□□ 0.93
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CS-231ENST00000552222 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.78■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 RGL3Q3MIN7 710 aa20.77■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.77■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.77■□□□□ 0.92
CS-231ENST00000552222 ABCA3Q99758 1704 aa20.76■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.76■□□□□ 0.91
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CS-231ENST00000552222 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.75■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 TRIM37O94972 964 aa20.74■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.74■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 NRAPQ86VF7 1730 aa20.73■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.73■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
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CS-231ENST00000552222 PSME1Q06323 249 aa20.71■□□□□ 0.91
CS-231ENST00000552222 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.7■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 ABCC11Q96J66 1382 aa20.69■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.68■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.68■□□□□ 0.9
CS-231ENST00000552222 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
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CS-231ENST00000552222 APBA3O96018 575 aa20.66■□□□□ 0.9
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CS-231ENST00000552222 IFT172Q9UG01 1749 aa20.65■□□□□ 0.9
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CS-231ENST00000552222 ARHGEF10O15013 1369 aa20.63■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 CHRNA2Q15822 529 aa20.63■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 PRAM1Q96QH2 718 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 USP35Q9P2H5 1018 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 STRN4Q9NRL3 753 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 PIK3C2GO75747 1445 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-231ENST00000552222 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.59■□□□□ 0.89
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